Mol Cancer:科学家成功开发出针对人类胃癌的新型遗传分类系统
来源:生物谷原创 2023-11-17 10:17
来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心等机构的科学家们通过研究开发了一种新型胃癌遗传分类系统,或有望为个体化胃癌疗法的开发奠定一定的基础。
胃腺癌(GAC,gastric adenocarcinoma)是一种具有基因组和临床异质性的致死性疾病;近日,一篇发表在国际杂志Molecular Cancer上题为“Clinically conserved genomic subtypes of gastric adenocarcinoma”的研究报告中,来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心等机构的科学家们通过研究开发了一种新型胃癌遗传分类系统,或有望为个体化胃癌疗法的开发奠定一定的基础。
此前研究人员在Hepatology杂志上也发表了与肝癌相关的遗传分类系统有关的研究文章,胃癌具有一定的遗传和临床多样性;研究人员对过去发表的针对8种胃癌的基因分类系统进行了分析,共得出了6种共识基因组亚型(CGSs,Consensus Genomic Subtypes)的结果,该系统能根据不同的基因表达模式将胃癌分类为CGS1到CGS6。每一种亚型都有不同的特征,CGS1能表现出最差的预后特征,其具有非常高的干细胞特性和较低的遗传修饰;然而,研究人员的分析证实了CGS1对免疫疗法反应较好,而且针对IGF1R的疗法或许也是有效的,CGS2则会在典型的上皮细胞基因表达中富集,CGS3和CGS4具有较高的克隆数变异,且对免疫疗法的反应较低。
科学家成功开发出针对人类胃癌的新型遗传分类系统。
图片来源:Molecular Cancer (2023). DOI:10.1186/s12943-023-01796-w
尽管如此,CGS3也具有HER2基因激活的特征,CGS4具有SALL4基因激活的特征;研究人员表示,靶向作用这些特征的疗法或许是有效的,CGS5具有较高的突变负担,而这是肿瘤中微卫星不稳定性的特征,对于免疫疗法有着中等反应;CGS6对于感染性单核细胞增多症病毒(EB病毒,Epstein Barr virus)呈现阳性表现,且甲基化水平较高,其对于免疫疗法也能表现出较高的反应。
研究人员不仅对胃癌的遗传学进行了分类,而且还通过对基因组和蛋白质组数据的系统性分析,评估了每个亚型的标准治疗和实验治疗(放化疗和免疫疗法等)的潜在应答率;因此,由于高水平脂质过氧化所导致的铁依赖性细胞死亡,CGS3亚型在抗癌放疗中表现出特别大的益处;相关研究或许提出了每种亚型的潜在治疗对象。
研究者Sun Young Yim教授说道,尽管由于新型疗法的实施,胃癌患者的死亡率正在不断下降,但其仍然是癌症患者的主要死亡原因之一,我们相信本文研究或许为后期开发新型个体化胃癌疗法奠定了一定的基础。综上,这种新型的共识亚型或许能帮助产生一种强大的分类系统,从而为基于亚型的定制化干预措施提供额外的特征。(生物谷Bioon.com)
原始出处:
Jeong, Y.S., Eun, YG., Lee, S.H. et al. Clinically conserved genomic subtypes of gastric adenocarcinoma. Mol Cancer 22, 147 (2023). doi:10.1186/s12943-023-01796-w
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