PLoS Biol：肠道真菌与人类健康——科学家揭秘基因与微生物的神秘联系！

如今，随着生活方式的改变和环境因素的影响，人类慢性疾病的发病率不断攀升，WHO数据显示，心血管疾病已成为全球死亡率最高的疾病之一，每年夺去约1790万人的生命；越来越多的研究表明，肠道微生物与人体健康密切相关，然而，大多数研究都集中在肠道细菌上，而对肠道真菌的研究相对较少。

近日，一篇发表在国际杂志PLoS Biology上题为“Gut fungi are associated with human genetic variation and disease risk”的研究报告中，来自宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家们通过研究揭示了肠道真菌与人类基因变异及疾病风险之间的联系，为理解人类健康提供了新的视角。肠道微生物群落（包括细菌、真菌等）对人体健康有着深远的影响，此前研究大多聚焦于肠道细菌，而对肠道真菌的研究相对匮乏。肠道真菌（即肠真菌群）在人体健康和疾病中的作用逐渐受到关注，这项研究中，研究人员旨在通过全基因组关联研究（GWAS），探索人类基因变异与肠道真菌相对丰度之间的关系，并进一步探讨这些基因变异是否与疾病风险相关。

文章中，研究人员利用人类微生物组计划（HMP）的数据，对125名健康个体的肠道真菌和人类基因组数据进行了相关分析。通过高通量测序技术，他们对肠道真菌的内部转录间隔区（ITS）进行了测序来鉴定和量化肠道真菌；同时利用全基因组测序技术获取了参与者的基因组数据，通过生物信息学分析，研究者们将肠道真菌的相对丰度与人类基因变异进行了关联分析。

真菌的相对丰度或能以一种组织特异性的相对基因表达方式与真菌相关突变-表达数量性状位点和变异有关

首先，研究人员对肠道真菌的ITS区域进行测序和分析来确定肠道真菌的种类和相对丰度；其次，对参与者的基因组进行全基因组测序，筛选出与肠道真菌相对丰度相关的基因变异；最后，通过统计分析和生物信息学工具来评估这些基因变异与疾病风险之间的关系。研究者表示，他们共检测到了148个与肠道真菌相对丰度相关的基因变异（FAVs），这些变异分布在7条染色体上且与9种真菌类群存在统计学关联；其中，一些基因变异位于编码PTPRC、ANAPC10、NAV2和CDH13等蛋白的基因中。特别值得注意的是，肠道酵母菌Kazachstania的相对丰度与CDH13基因的遗传变异存在关联，而CDH13基因与心血管疾病风险相关；进一步的孟德尔随机化分析表明，Kazachstania与心血管疾病风险之间存在因果关系。

这项研究中，研究人员首次系统地揭示了人类基因变异与肠道真菌之间的关联，并进一步探讨了这些关联与疾病风险之间的联系，相关研究结果不仅丰富了科学家们对肠道微生物群落与人类健康关系的理解，还为未来的个性化医疗提供了新的思路。肠道真菌Kazachstania与心血管疾病风险的关联提示我们，肠道微生物群落或能通过影响宿主的基因表达和代谢途径进而影响慢性疾病的发生和发展。（生物谷Bioon.com）

参考文献：

Emily P. Van Syoc,Emily R. Davenport,Seth R. Bordenstein. Gut fungi are associated with human genetic variation and disease risk. PLoS Biology. doi:10.1371/journal.pbio.3003339