Nature：利用细胞类型丰度表型对类风湿性关节炎进行分层

类风湿性关节炎（rheumatoid arthritis, RA）是一种自身免疫性疾病，其特点是炎症导致疼痛、关节损伤和残疾。全球约有 1800 万人受到这种疾病的影响。虽然针对特定炎症通路的RA疗法已经出现，但只有部分患者的症状在治疗后有所改善，这强调了针对不同疾病亚型采取多种治疗方法的必要性。

为了更准确地确定RA的细胞驱动因素，来自美国布罗德研究所、布莱根妇女医院和哈佛医学院等研究机构的研究人员在一项新的研究中，通过整合多种分析形式，在单细胞水平上分析了RA供者的组织，按六种炎症亚型对RA进行了分层。这些研究结果揭示了导致RA的多种细胞病因，为更有针对性、更有效、更适合患者的治疗方法提供了依据。相关研究结果于2023年11月8日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Deconstruction of rheumatoid arthritis synovium defines inflammatory subtypes”。

论文通讯作者、布莱根妇女医院的Soumya Raychaudhuri博士说，“在治疗RA患者的过程中，我们一直在努力寻找适合患者的治疗方法。我们的目的是通过观察炎症的亚型来确定为什么一些患者对常规治疗没有反应。我们从多个不同的角度进行了研究，使用了多种前沿的单细胞技术，并以一种前所未有的方式整合了炎症性疾病的研究结果。”

这些作者分析了来自供者的79份滑膜组织样本，其中滑膜组织通常有助于缓冲和维持关节，但在RA患者中，该组织发炎。特别地，他们检查了来自新发疾病患者和对治疗无反应的患者的滑膜组织，以更好地识别RA的初始驱动因素和难治性RA的驱动因素。

为了在细胞水平上“破解”RA病理学，这些作者将表面蛋白数据和组织学分析与多种形式的单细胞RNA测序和批量RNA测序（bulk RNA sequencing）结合起来。尽管分析 314000 多个细胞所使用的方法多种多样，但是他们还是一致发现了六种主要炎症类型的证据，并根据称为细胞类型丰度表型（cell-type abundance phenotype, CTAP）的相关细胞类型进行了分层。

虽然一些CTAP，如T细胞和B细胞中富含的CTAP，对于像RA这样的自身免疫性疾病来说是意料之中的发现，但是这些作者惊讶地观察到与成纤维细胞和内皮细胞等结构细胞有关的CTAP，与相对较少的炎症性白细胞相关的CTAP。他们还发现，患者的CTAP是动态变化的，在对治疗作出的过程中会随着时间的推移而改变。

多模态单细胞滑膜组织管道和细胞类型丰度分析，揭示不同的类风湿关节炎CTAP。图片来自Nature, 2023, doi:10.1038/s41586-023-06708-y。

展望未来，这些作者的目标是通过研究细胞之间的相互联系如何促进疾病状态，扩大他们对参与RA的细胞类型的了解。此外，他们还希望这项新研究能促进对RA患者进行更多的滑膜组织分析，目前这还不是标准做法。虽然血液检测在RA患者中更为常见，但这项研究和其他研究的结果强调，滑膜组织的细胞谱与血液有很大不同。

论文共同作者、布莱根妇女医院风湿病、炎症与免疫科的Michael Brenner博士说，“这项新研究表明滑膜组织很重要。我们的研究结果表明，滑膜组织活检对评估病理过程的性质很有价值，因为不同患者的病理过程可能大相径庭。未来的临床试验将大大受益于在评估治疗反应的同时评估组织特征。通过提供这种参与RA的细胞类型和通路图谱，我们能够更好地实现精准医疗的目标，即为合适的患者选择合适的药物，并实现高反应率。”（生物谷 Bioon.com）

参考资料：

Fan Zhang et al. Deconstruction of rheumatoid arthritis synovium defines inflammatory subtypes. Nature, 2023, doi:10.1038/s41586-023-06708-y.

Cellular 'atlas' built to guide precision medicine treatment of rheumatoid arthritis
https://www.brighamandwomens.org/about-bwh/newsroom/press-releases-detail?id=4579