Cell：新研究为癌症转移的基因组基础提供了新见解

2022年2月8日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSK）的研究人员取得的新发现支持癌症科学中的一个新兴框架，即认为癌症转移主要不是由基因突变驱动的，而是由由于癌细胞与周围环境中的正常细胞相互作用而发生的表观遗传学变化驱动的。鉴于目前90%的癌症死亡是由癌症转移引起的，这一新数据有助于揭开围绕癌症转移的神秘面纱。相关研究结果发表在2022年2月3日的Cell期刊上，论文标题为“Genomic characterization of metastatic patterns from prospective clinical sequencing of 25,000 patients”。

大约六年前，一项合作研究开始确定是否有可能仅根据肿瘤的基因组图谱来预测肿瘤会转移到哪些器官。具体来说，人们想知道在许多不同的癌症类型中，某些突变或突变组合是否与癌症向特定器官的扩散相关联。

论文共同通讯作者、MSK流行病学与生物统计学系计算肿瘤学家Nikolaus Schultz博士说，“虽然我们确实发现一些基因突变在具有特定转移过渡的肿瘤样本中略为常见，但我们没有发现任何单一基因在发生突变时，能够预测肿瘤转移到特定器官的可能性。”

这些作者利用复杂的计算技术，从MSK-IMPACT中提取数据。MSK-IMPACT是一种独特的工具，用于寻找400多个癌症相关基因的突变，并帮助临床医生根据单个基因组改变选择治疗方案。自2014年以来，MSK已经汇编了数千人的基因肿瘤资料，包括50种不同癌症类型的25000名患者，他们的原发性和转移性肿瘤都被测序了（在这个项目中进行了分析）。

图片来自Cell, 2022, doi:10.1016/j.cell.2022.01.003。

在最高层面上，这些数据显示转移性肿瘤在基因组上与原发性肿瘤不同。在许多---但不是所有---癌症类型中，与原发性肿瘤相比，转移性肿瘤有更多遗传学家所说的DNA拷贝数变化。当某个特定DNA片段的拷贝数大于或小于正常拷贝数时，就会发生DNA拷贝数的变化。这些拷贝数变化当在原发性肿瘤中观察到时，是转移潜力的一个指标。此外，在不同的癌症类型中，与发性肿瘤相比，一些驱动癌症的突变以不同的频率在转移瘤中被检测到。

探索这些数据和其他发现的影响将是MSK新成立的玛丽-乔西和亨利-克拉维斯癌症生态系统项目的重点。该项目旨在开发新一代的治疗方法，其基础是对癌症内在驱动因素（包括基因）的理解，以及对培育和维持这些危险细胞的环境的新见解。这项雄心勃勃的研究和技术开发工作将癌症视为一种系统性疾病---一种始于单个部位但依赖整个身体的条件而茁壮成长和扩散的疾病。

总的来说，在大规模测序和相关的患者临床数据中可能会发现更多的信息，这些信息可能有助于作出治疗决策。为了帮助科学家们挖掘这些新数据以获得更多的见解，MSK团队正在通过MSK-MET（Memorial Sloan Kettering-Metastatic Events and Tropisms）的癌症基因组学cBioPortal公开提供这些数据。

Schultz博士说，“如果得到适当的分析，这些数据可以告诉我们更多关于这些患者的预后，他们的肿瘤是否会转移，甚至可能转移到什么组织。这些信息可能有助于确定如何监测这些患者，或深入了解他们可能对哪些治疗方法更敏感或不敏感。我认为个性化医疗有巨大的潜力，它超越了单一的生物标志物，因此有理由继续用更广泛的测序方案对更多的患者进行测序，以增加我们做出新发现的能力。”（生物谷 Bioon.com）

参考资料：

Bastien Nguyen et al. Genomic characterization of metastatic patterns from prospective clinical sequencing of 25,000 patients. Cell, 2022, doi:10.1016/j.cell.2022.01.003.