Cell Death and Disease:科学家们揭示了乳腺癌的亚型特异性治疗基因靶点及其microRNA调控网络
来源:生物谷原创 2023-07-27 11:38
乳腺癌是世界范围内最常见的恶性疾病,也是女性死亡的第二大原因。BC的临床治疗取决于肿瘤大小、结节状态、远处转移和BC分子亚型。
乳腺癌是世界范围内最常见的恶性疾病,也是女性死亡的第二大原因。BC的临床治疗取决于肿瘤大小、结节状态、远处转移和BC分子亚型。根据雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和HER2的表达,BC在临床上分为三个主要亚型,这些生物标记物的表达在确定治疗策略中起着至关重要的作用。
图片来源:https://doi.org/10.1038/s41419-023-05908-8
近日,来自哈马德·本·哈利法大学的研究者们在Cell Death and Disease杂志上发表了题为“Transcriptome profiling and network enrichment analyses identify subtype-specific therapeutic gene targets for breast cancer and their microRNA regulatory networks”的文章,该研究数据提供了全面的转录图谱,解开了该地区BC患者的miRNA-mRNA调控网络,并采用整合的方法确定了新的可操作的基因靶点。目前的研究结果对改善中东和北非以及其他种族患者目前的BC护理标准具有潜在的意义。
先前的研究表明,中东和北非(MENA)的乳腺癌(BC)年龄较小,肿瘤分期较晚期,这表明潜在的生物学差异。鉴于中东和北非地区关于BC的转录转录数据很少,为了更好地了解这种疾病的生物学,研究者对来自卡塔尔的BC当地队列(n=96)进行了mRNA和microRNA(MiRNA)转录图谱分析。
本研究数据显示,差异表达的基因和miRNA与BC分子亚型(HR+、HER2+、HER2+HR+和TNBC)、肿瘤分级(GIII与GI-II)、患者年龄(年轻(≤40岁)与老年(>40岁)以及种族(MENAVS非MENAs)有关。
图谱数据显示TNBC与HER2+非常相似,而HER2+HR+肿瘤的转录组与HR+肿瘤相似。网络分析发现,在每个BC分子亚型、高级别肿瘤与低级别肿瘤、年轻患者与老年患者的肿瘤以及MENA与非MENA的肿瘤中,都存在复杂的miRNA-mRNA调控网络,这表明miRNA介导的基因调控是形成BC转录组的一个重要机制。
将本研究的转录数据与CRISPR-Cas9功能筛查数据和OncoKB数据库整合在一起,发现了每个BC分子亚型中的许多依赖性和治疗漏洞,而CDC123被功能验证为TNBC的潜在治疗靶点。Cox回归生存分析确定了基于mRNA和miRNA的信号可以预测更差和更好的无复发生存率(RFS),这在更大的BC队列中得到了验证。
基于miRNA表达的BC层次聚类
图片来源:https://doi.org/10.1038/s41419-023-05908-8
本研究的数据提供了BC分子亚型、不同疾病级别的肿瘤以及中东和北非地区患者的年龄和种族之间的mRNA和miRNA表达变化的综合图谱。本研究的数据为每个BC分子亚型确定了许多新的治疗靶点,预计这些靶点的表现将超过现有的治疗方法。
这些发现仍需在临床前动物模型中进行有效性和安全性测试。此外,研究者的数据确定了能够预测患者RFs并区分每个BC分子亚型的基因和mRNA特征,这在分子诊断中具有潜在的应用价值。(生物谷 Bioon.com)
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