Cell子刊：发现与炎症性肠病相关的肠道细菌菌株

炎症性肠病（IBD）影响着数百万人，而且发病率越来越高。在一项新的研究中，来自麻省总医院的研究人员发现特定的肠道细菌菌株与炎症性肠病（inflammatory bowel disease, IBD）有关。这一发现可能会带来新的诊断和治疗方法。相关研究结果于2024年6月24日在线发表在Cell Host & Microbe期刊上，论文标题为“Discovery of disease-adapted bacterial lineages in inflammatory bowel diseases”。

论文第一作者、麻省总医院医学研究员 Adarsh Kumbhari 博士说，“炎症对肠道细菌造成了巨大的选择性压力，因此我们假设肠道微生物组可能包含独特的细菌谱系，这些细菌谱系不仅数量更多，而且在遗传上适应这些炎症疾病。为了验证这一点，我们利用进化方法发现了IBD（包括克罗恩病和溃疡性结肠炎）环境中的细菌菌株。”

Kumbhari指出，识别这些菌株可能能够揭示肠道细菌在炎症期间生存的分子策略，并发现影响疾病风险的新的肠道微生物组-宿主相互作用。

在这项新的研究中，这些作者首先分析了数千名 IBD 患者和健康对照者粪便样本中的细菌菌株基因型。他们揭示了数百种在 IBD 样本中更为突出的细菌谱系，它们的菌株显示出与这种疾病的长期进化关联性。

接下来，这些作者通过对个别 IBD 患者的粪便样本进行长期分析，发现这些疾病相关菌株在炎症加剧期间比健康菌株更有竞争力，这意味着它们获得了基因创新，从而在 IBD 期间获得了生存优势。

图片来自Cell Host & Microbe, 2024, doi:10.1016/j.chom.2024.05.022

与健康相关菌株相比，这些疾病相关菌株的基因差异对应到炎症的已知方面，包括氧化应激、营养物合成和免疫系统逃避。

论文通讯作者、麻省总医院计算与整合生物学中心首席研究员Christopher S. Smillie博士说，“我们还发现，健康相关菌株的缺失预示着粪便中钙卫蛋白（calprotectin）水平的升高，而钙卫蛋白是炎症严重程度的标志物。我们的发现可能具有诊断作用，也有可能指导对IBD和其他免疫介导疾病进行有针对性的干预。”（生物谷Bioon.com）

参考资料：

Adarsh Kumbhari et al. Discovery of disease-adapted bacterial lineages in inflammatory bowel diseases. Cell Host & Microbe, 2024, doi:10.1016/j.chom.2024.05.022.