Nat Biotechnol：基于CRISPR技术开发的工程化噬菌体或有望选择性地杀灭机体的大肠杆菌

很多人都有被大肠杆菌感染的经历，而这常常被认为是一件让人不愉快的一件事情，对于诸如血液癌症等某些患者而言，或许存在着细菌进入到患者机体血液的风险，而在这些情况下，大肠杆菌的感染往往是致命的，其致死率大约为15%-20%。而治疗这种感染的主要方法就是使用抗生素，其会对患者机体的微生物组带来不利的影响，而微生物组在身体健康和情感健康上扮演着非常关键的角色，但其也会带来其它副作用；此外，如今越来越多的抗生素耐药性问题就会使得这种疗法在治疗感染方面变得不再有效。

近日，一篇发表在国际杂志Nature Biotechnology上题为“Engineered phage with antibacterial CRISPR–Cas selectively reduce E. coli burden in mice”的研究报告中，来自丹麦科技大学生物可持续发展中心等机构的科学家们通过研究设计出了一种基于CRISPR的候选药物，其能直接靶向作用大肠杆菌且能保持患者机体微生物组的完整性，文章中，研究人员描述了这种候选药物的开发过程，而且该候选药物已经准备在人类机体中进行临床试验了。

基于CRISPR技术开发的工程化噬菌体或有望选择性地杀灭机体的大肠杆菌。

图片来源：Nature Biotechnology (2023). DOI:10.1038/s41587-023-01759-y

通过广泛使用合成生物学相关技术，研究人员设计出了四种细菌病毒，其能利用CRISPR技术来精确杀灭不需要的细菌；研究者Morten Otto Alexander Sommer说道，我们认为，具有这些特性的窄谱药物对于癌症患者非常有用，因为其经常会遭受严重感染，且利用当前的抗生素难以治疗。研究人员筛选出了162种自然发生的噬菌体（能杀灭特定细菌的病毒），结果发现，其中8种噬菌体有望靶向作用大肠杆菌，随后研究者通过基因编辑手段来对其进行工程化改造从而改善其靶向狙杀大肠杆菌的能力。

研究人员将这四种噬菌体的混合制剂命名为SNIPR001，其能非常有效地靶向作用细菌的生物膜并以超过自然发生的噬菌体的方式来减少大肠杆菌的数量；此外，他们还发现，这种噬菌体混合制剂在小鼠和迷你猪机体肠道中的耐受性良好，同时还能减少大肠杆菌的产生或出现；目前SNIPR001正在进行临床研发，且已经获得了FDA的加速审查。

综上，本文研究结果表明，目前研究人员正在对SNIPR001噬菌体制剂进行临床研究和开发，旨在利用其来选择性地杀灭大肠杆菌，因为大肠杆菌或许会在血液病癌症患者机体中诱发致死性的感染。（生物谷Bioon.com）

原始出处：

Gencay, Y.E., Jasinskytė, D., Robert, C. et al. Engineered phage with antibacterial CRISPR–Cas selectively reduce E. coli burden in mice. Nat Biotechnol (2023). doi：10.1038/s41587-023-01759-y