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Nat Commun:利用特殊的基因标签或能预测肺癌患者对化疗的反应

来源:生物谷原创 2022-10-18 13:35

来自Francis Crick研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种方法或能帮助预测是否肺癌患者会对化疗产生反应,其主要依据肿瘤中的哪些基因被开启表达。

32%的肺腺癌(LUAD,lung adenocarcinomas)中都会发生KRAS的激活突变,尽管在临床前研究中,研究者发现,KRAS的突变引起了恶性疾病和癌症对疗法耐受性的发生,但其突变并不能预测患者的治疗结局以及对疗法的反应,这或许是由于调节RAS途径的额外事件所导致的。

近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“RAS oncogenic activity predicts response to chemotherapy and outcome in lung adenocarcinoma”的研究报告中,来自Francis Crick研究所等机构的科学家们通过研究开发了一种方法或能帮助预测是否肺癌患者会对化疗产生反应,其主要依据肿瘤中的哪些基因被开启表达。

近些年来,癌症研究人员不断增加理解特定的基因突变是如何影响肿瘤发生、进化和对疗法产生反应的,然而,仅仅是突变的存在并不能提供关于肿瘤生物学的完整图像。这篇研究报告中,研究人员分析了肿瘤中不同基因的表达,以及哪些基因会被开启或关闭表达。研究人员重点关注了与RAS信号通路相关的基因,他们分析了包含癌细胞种这些基因活性信息的数据库,通过这些数据库以及AI的帮助,研究人员就绘制出了84个基因的独特基因签名。

利用特殊的基因标签或能预测肺癌患者对化疗的反应。

图片来源:Nature Communications (2022). DOI:10.1038/s41467-022-33290-0

当研究人员回顾500多名已经接受治疗的肺癌患者机体的数据时,他们发现,利用基因特征或许就能正确预测哪些患者会因化疗而获益,哪些患者不会因化疗而获益。研究者Sophie de Carne说道,随着许多癌症疗法的出现以及很多药物正处于临床试验中,预测哪种疗法对特定患者治疗成功的机会最大对于科学家们而言是一大挑战,因为我们知道,RAS信号主要参与了多种耐药性机制的发生,为此研究人员就希望这种基因特征或许就能帮助定义能从特定疗法中获益的患者群体。

与此同时,研究人员还有大量工作需要去完成,目前他们需要在临床试验中进行检测,同时他们也在不断调整方法来使其更容易被使用。Julian Downward博士说道,本文研究工作表明,RAS信号通路对于解释为何肺癌患者对化疗的反应不同非常关键,该通路中基因表达的水平要比在特定基因突变存在时更具有决定性,包括KRAS基因的突变等。

在先进的计算工具的帮助下,研究人员如今就能利用关于癌症的大量数据,相关研究结果也揭示了科学家如何利用这些数据库来帮助改善患者的治疗结局。后期研究人员还会继续深入研究,包括研究是否其获得的基因标签是否能用于预测哪些患者能更容易从免疫疗法中获益,尽管这些基因标签能针对肺癌进行优化,但这种方法同时也能被用于开发其它癌症的标签。综上,本文研究结果表明,利用致癌特性的KRAS转录活性而并非遗传改变特征来对患者进行分层或许能帮助临床医生进行临床决策的制定。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

East, P., Kelly, G.P., Biswas, D. et al. RAS oncogenic activity predicts response to chemotherapy and outcome in lung adenocarcinoma. Nat Commun 13, 5632 (2022).doi:10.1038/s41467-022-33290-0

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