研究揭示RNA poly(A)尾巴内部广泛存在其他碱基修饰
来源：遗传所 2019-12-01 19:15
RNA poly(A)尾巴是成熟的mRNA和lncRNA的重要组成部分，对RNA稳定性和翻译起着重要的调控作用。然而目前的poly(A)尾巴检测技术仍然非常有限。11月22日，中国科学院遗传与发育生物学研究所陆发隆研究组在《自然-通讯》（Nature Communications）发表题为Poly(A) inclusive RNA isoform sequencing (PAIso-seq) re
RNA poly(A)尾巴是成熟的mRNA和lncRNA的重要组成部分，对RNA稳定性和翻译起着重要的调控作用。然而目前的poly(A)尾巴检测技术仍然非常有限。11月22日，中国科学院遗传与发育生物学研究所陆发隆研究组在《自然-通讯》（Nature Communications）发表题为Poly(A) inclusive RNA isoform sequencing (PAIso-seq) reveals wide-spread non-adenosine residues within RNA poly(A) tails 的文章，建立了一种称为PAIso-seq的高灵敏度高准确度的RNA poly(A)尾巴检测技术。
通过PAIso-seq发现转录组中存在数kb长的poly(A)尾巴。全长RNA信息让研究人员可以去探索RNA可变剪切与poly(A)尾巴这两种重要RNA转录后调控之间的关联。PAIso-seq具有极高的灵敏度，能够在单个卵细胞中实现转录组水平的poly(A)尾巴的检测，为稀有微量样本的全转录组poly(A)尾巴分析提供了技术基础。包含poly(A)尾巴信息的全长转录本数据为研究者理解不同RNA转录后调控的协同作用与机制提供了重要的工具。
更有意思的是通过PAIso-seq发现poly(A)尾巴并不仅是人们之前认为的一段纯A序列，也不仅仅在3’末端存在其他碱基修饰(U， G，C)。该研究揭示了在小鼠GV期卵中有超过17%的mRNA poly(A)尾巴的主体区域存在广泛的U、G和C碱基的掺入。该发现将改写教科书中关于RNA poly(A)尾巴组成的描述。近期在拟南芥、线虫和人细胞系中也发现了poly(A)尾巴的主体中含有非A碱基，其中在线虫和人细胞系研究中开发的FLAM-seq方法与PAIso-seq方法都是基于PacBio三代测序平台。相较FLAM-seq而言，PAIso-seq在灵敏度上有非常大的优势。这些新发现的poly(A)尾巴内部的非A碱基如何生成，对RNA起着什么样的调控作用是接下来要回答的重要问题，该发现以及PAIso-seq方法为RNA转录后调控研究打开了一扇全新的大门。(生物谷Bioon.com）
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