Nature子刊:科学家开发可执行复杂功能的细胞生物计算机
来源:科技部生物中心 2023-01-18 15:30
近日,发表在《Nature Communications》上的一项新研究中,来自以色列理工学院和麻省理工学院的科学家共同合作,将电气工程概念与生物工程工具结合在一起,首次在活细胞中创造出用于执行人工
近日,发表在《Nature Communications》上的一项新研究中,来自以色列理工学院和麻省理工学院的科学家共同合作,将电气工程概念与生物工程工具结合在一起,首次在活细胞中创造出用于执行人工神经回路等复杂功能的细胞“生物计算机”。
研究团队通过将质粒上的基因设计成一台简单的计算机,即人工神经网络。然后,将新方法与现有的基因工程方法相结合,设计了合成计算电路,并将神经形态电子学的概念应用到细菌细胞中,创造出可以使用人工智能算法训练的细菌细胞。这些细胞可以动态重新编程,在执行“或”与“和”功能之间进行切换,以在不同条件下执行不同操作。研究人员为了在活细胞中实施人工神经网络,定义了一个基于对数的感知器版本,称为感知基因(图 1a),其对数输入输出操作使其更适合生化反应和基因的非线性特性规定。perceptgene 实现了一个对数分类器,该分类器将所有输入值渐进地划分为两类输出数据点(图 1a,右)。
此外,研究人员成功利用细胞对梯度的自然感知特性,制造了一个模数转换器,这是一种能报告特定分子浓度是“低”“中”还是“高”的细胞,这种传感器可以用于递送正确剂量的药物,包括癌症免疫治疗和糖尿病药物。
总之,研究人员创建了多层感知基因电路,可以计算软多数函数、执行模数转换并实现三元开关。还创建了一个可编程的感知基因电路,其计算可以使用小分子归纳法从 OR 修改为 AND 逻辑。创建和控制细胞过程的能力为更复杂的编程铺平了道路,为生物制造和治疗领域提供了有价值的线索。
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