研究揭示人源TRPC5通道被不同小分子所抑制的结构基础
来源:北京大学 2021-03-23 08:22
TRPC5是受体激活的非选择性阳离子通道,属于瞬时受体电位通道(TRP)家族中的经典型亚家族(TRPC)1。TRPC5通道的激活将引起细胞膜去极化和胞质内钙浓度上升。TRPC5通道主要表达于脑组织,在肝脏、肾脏等器官中也有一定程度的分布2-4。TRPC5介导多种生理过程,与恐惧、焦虑、抑郁等情绪的产生以及进行性肾脏疾病有关5,6。近期
TRPC5是受体激活的非选择性阳离子通道,属于瞬时受体电位通道(TRP)家族中的经典型亚家族(TRPC)1。TRPC5通道的激活将引起细胞膜去极化和胞质内钙浓度上升。TRPC5通道主要表达于脑组织,在肝脏、肾脏等器官中也有一定程度的分布2-4。TRPC5介导多种生理过程,与恐惧、焦虑、抑郁等情绪的产生以及进行性肾脏疾病有关5,6。近期研究表明TRPC5通道是治疗焦虑、抑郁和肾病的潜在药物靶点7-9。目前,由Hydra公司和Boehringer Ingelheim合作开发的一种TRPC4/5抑制剂正在临床试验中,用于治疗焦虑和抑郁10;由Goldfinch Bio开发的TRPC5抑制剂GFB-887(NCT number: NCT03970122)正处于治疗肾病的临床I期试验中。尽管TRPC5抑制剂的开发如火如荼,TRPC5抑制剂是如何结合TRPC5通道并发挥抑制作用的仍不清楚。
北京大学未来技术学院分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心陈雷研究组在eLife杂志上报道了人源TRPC5通道分别与两种小分子抑制剂结合的高分辨结构。
作者们纯化了C端截短的人源TRPC5(hTRPC51-764),该截短体具有比全长TRPC5更高的四聚体表达量,并且像全长TRPC5一样,仍然能被激活剂(-)-englerin A(简称EA)和高浓度胞外钙激活,也能被抑制剂clemizole(简称CMZ)和HC-070抑制。CMZ是苯并咪唑衍生物,HC-070是甲基黄嘌呤衍生物,对TRPC4、TRPC5具有很高的抑制效力。这两类抑制剂具有截然不同的大小、形状和化学特性,因而可能结合在TRPC5上的不同位置。作者们向纯化后的hTRPC51-764蛋白样品中分别添加CMZ和HC-070,制备了冷冻电镜样品,通过单颗粒冷冻电镜技术获得了2.7?高分辨率的hTRPC51-764与CMZ结合的电子密度和hTRPC51-764与HC-070结合的电子密度并搭建了原子模型。
结构显示抑制剂结合的TRPC5具有四重对称性(图1),整个通道由跨膜区和胞质区组成,并且通道处于关闭状态。
CMZ结合在跨膜区的由跨膜螺旋S1-S4组成的电压传感器样结构域(VSLD)(图2)。与CMZ距离近的氨基酸中,F414与CMZ的氯苯环形成π-π堆积作用;Y374,M442,Y446和P659与CMZ形成疏水相互作用(图2)。功能实验结果显示,将N443突变成TRPC3/6上对应的氨基酸亮氨酸后,CMZ的抑制效力明显减弱(图2),说明N443对于CMZ发挥抑制作用很重要,也解释了CMZ对于TRPC不同亚型的选择作用。
HC-070结合在跨膜区的孔道结构域,结合位点由一个亚基的跨膜螺旋S5、孔道螺旋和相邻亚基的跨膜螺旋S6组成 (图3)。HC-070与TRPC5上的众多氨基酸有相互作用:F576的侧链与HC-070的甲基黄嘌呤形成π-π堆积作用;R557,Q573,W577与HC-070的羟丙基形成极性相互作用;F599,A602和T603同时也参与稳定羟丙基;F569和L572与HC-070的氯苯环形成疏水相互作用(图3)。功能实验结果显示,HC-070对以下这些突变体:R557A, F569A, L572A, Q573A,F599A,F599N,T603A的抑制效力减弱,其中,对Q573A的抑制效力减弱得最明显(图3),说明Q573A与HC-070羟丙基形成的氢键对于HC-070结合并抑制TRPC5具有至关重要的作用。
在电子密度图中,作者还观察到了结合的离子和脂类。其中一个可能的离子结合位点位于跨膜区的VSLD,由E418,E421,N436和D439组成(图4)。在鼠源TRPC4和鼠源TRPC5中也曾观察到相似密度11,12;在TRPM2,TRPM4和TRPM8中观察到的相似密度被鉴定为钙离子13-15。作者们发现E418Q-E421Q-D439N三突变体失去了对胞外钙的响应,说明该位点对于钙激活有着至关重要的作用。观察到的另一个可能的离子结合位点位于胞质区,由H172,C176,C178,C181组成,类似于细菌中葡糖激酶的HC3型锌结合位点16。C176A-C178A-C181A三突变体对EA和钙的响应不变,说明该位点可能参与离子通道门控以外的其他调控作用。
在跨膜区有数个脂类/去垢剂结合位点 (图4)。在结合CMZ的TRPC5电子密度图中,在跨膜螺旋S5和S6之间观察到了类似DAG的密度。HPLC-MS实验也证明蛋白样品中含有DAG。在结合HC-070的TRPC5电子密度图中,DAG头部的密度被HC-070替代了,而两条脂肪链尾巴的密度却还保留着。(生物谷Bioon.com)
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