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Genome Biol:杨力组开发基于深度学习的计算分析框架实现RNA测序数据直接鉴别RNA编辑与DNA突变位点

DEMINING框架通过嵌入的深度学习模型DeepDDR,实现了从RNA测序数据中高效、精确地鉴定RNA编辑和DNA突变。

2024-10-16

Nature Methods:如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?

随着单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)等技术的引入,研究人员得以从单个细胞的角度揭开胚胎发育的秘密,描绘出生命起始的动态蓝图。

2024-11-24

Nature Methods : 如何利用单细胞RNA测序解读人类胚胎发育的每一步?

研究人员借助干细胞技术构建了胚胎模型(stem cell-based embryo models),用于模拟人类胚胎的发育。

2024-12-09

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。

2024-06-12

Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理

通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。

2024-09-26

Nat Biotechnol:科学家利用长读RNA测序技术识别出了阿尔兹海默病中的关键基因表达特征

文章中,研究人员利用了一种称之为长度测序(long-read sequencing)的尖端技术进行研究,这些技术能将对DNA和RNA的分析推向一个新的水平。

2024-06-14

Mol Cell | 李笑雨/伊成器团队合作开发不依赖于亚硫酸氢盐RNA m⁵C单碱基测序检测方法

该研究开发了直接检测m5C修饰的新技术m5C-TAC-seq,并展示了m5C-TAC-seq技术高灵敏、高精准的检测特性。

2024-07-16

Nature Cell Biology: RNA-RNA 相互作用调控果蝇 oskar mRNA 颗粒组装及营养应激响应

该研究深入揭示了oskar mRNA中的特定RNA-RNA相互作用在果蝇胚胎发育中的功能性和结构性角色。

2024-11-22

Mol Cell:RNA功能研究面临的挑战

六位国际专家从多个角度阐述了RNA功能研究所面临的挑战,涵盖了海量转录组数据的高效利用、AI对RNA功能研究的推动作用、RNA修饰的功能探索以及蛋白质-RNA互作对转录组调控的影响等多个方面。

2024-11-15

乔治·丘奇团队开发酶促RNA合成平台,扩展RNA疗法潜力,已成功合成siRNA药物

在这项最新研究中,研究团队开发并优化了一种水基、无模板的酶促RNA寡核苷酸合成平台,作为传统化学合成法的替代方案

2024-07-16