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单个细胞转录组测序成本降至1美分!《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术

 许多疾病,例如阿尔兹海默病和帕金森病,都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因,将有助于了解疾病的病因和进展情况,进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向,但是现有方法价格昂贵,且需要专门的设备,严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日,一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破,有望将单个细胞的测序成本降至

2018-03-20

单细胞测序平民化,测一个细胞仅需一美分,一次能测上千个细胞!

2018年3月19日讯 /生物谷BIOON /——来自艾伦学院和华盛顿大学的科学家们开发出了一种廉价的高级技术可以检测成百上千个细胞的基因表达。这项基于配位的转录组测序技术(Split Pool Ligation-based Transcriptome sequencing,SPLiT-seq)是一项可延展的用于表征单个细胞RNA水平的技术,可用于鉴定脑部疾病及其他组织中的不同细胞类型,这项研究于

2018-03-20

全转录组测序数据分析及案例实践班(第四期)

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-

2018-03-12

Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表

 在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)

2018-03-09

基因测序提速46倍 诺禾致源借阿里云绘制基因科学蓝图

 2017年的最后一周,我国启动了“中国十万人基因组计划”,绘制中国人的精细基因组图谱,这是我国在人类基因组研究领域实施的首个重大国家计划,需要在四年内完成全部的基因测序与分析任务。作为六家单位之一,北京诺禾致源参与了此次十万人基因组计划,借助阿里云的计算和存储能力,诺禾致源能在17分钟内就加载完1万个人类全基因组数据,仅用1.5小时就可完成单个基因测序pipeline,比此前快了46倍

2018-02-24

多篇研究共同解读近期单细胞测序重磅级研究成果

本文中,小编整理了近年来单细胞测序领域的重磅级研究成果,与大家一起学习!【1】Cell:开发出空间单细胞测序技术,有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜doi:10.1016/j.cell.2017.12.007在一项新的研究中,来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传模型可能解释着一种常见的被称作导管原位癌(ductal carcinoma in situ, DCIS)的早期乳腺癌

2018-01-29

Cell:开发出空间单细胞测序技术,有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜

2018年1月12日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传模型可能解释着一种常见的被称作导管原位癌(ductal carcinoma in situ, DCIS)的早期乳腺癌如何进展到更为浸润性的乳腺癌。相关研究结果于2018年1月4日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Multiclonal Invasion in Breast

2018-01-12

华大智造测序仪适配10X Genomics的Chromium系统

2018年1月8日,在中国深圳和美国普莱森顿,华大智造(MGI)和10X Genomics公司同时宣布BGISEQ-500RS与10X Genomics设备的linked reads技术和单细胞转录组建库技术兼容。同时,华大表示,在第12届国际基因组学大会上发布的MGISEQ-2000和MGISEQ-200也将兼容10X Genomics系统。这两款测序仪预计在2018年2月正式发售, 华大希望通

2018-01-09

2017年度聚焦:DNA测序深度分析

基因组学是一门研究生物基因组的组成,基因组中各基因的精确结构、相互关系及表达调控的科学。在基因组学中,科学家们通过新型的基因测序仪分析生物样本(组织、细胞、血液样本等)的基因组信息,并将这些信息用于临床医学诊断、个体化用药指导、疾病发病机理研究、生命调控机制研究等领域。图1.染色体、DNA和基因基因测序是一个新兴行业,处于快速发展阶段。全球基因测序行业的市场规模巨大。从1990年人类基因组计划(H

2017-12-29

我国科学家完成杜仲基因测序

 天然橡胶与石油、煤炭和钢铁并称为四大工业原料,是关系国计民生的基础产业和重要战略物资。杜仲是传统的名贵中药材,也是我国特有的产胶植物。在众多产胶植物中,杜仲产业化前景最大,极具开发潜力。近日,中国林业科学研究院经济林研究开发中心杜红岩团队、乌云塔娜团队联合中国热带农业科学院橡胶研究所李德军研究员团队及山东贝隆杜仲生物工程有限公司高瑞文高级工程师团队合作完成杜仲基因测序,相关成果发布于《

2017-12-11