空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Nature | 大规模结直肠癌基因组研究:寻找预后突变与治疗靶点
这项研究实现了迄今为止最大规模的结直肠癌基因组和转录组的综合分析,并将分子层面的发现与高质量的临床数据相结合,从而识别关键预后因子,这使这项研究有别于其他绝大多数癌症基因组学的研究。
2024-08-09
Nat Commun:朱冰研究组揭示小鼠母源蛋白Pramel15促进合子DNA去甲基化机制
本研究发现,Pramel15可以调节受精卵DNA复制过程中细胞核内DNMT1的水平,从而帮助早期胚胎中的DNA甲基化重编程。
2024-09-03
Nat Commun | 叶海峰/管宁子:探索植物源光敏色素伴侣蛋白助力哺乳动物光开关转录调控
团队开发了一种光开关平台,能够实现基因转录的正交、模块化和可调控的控制,并将其整合到PTRC控制的CRISPRa系统(PTRCdcas)中,以调节内源基因的表达。
2024-06-16
J Extracell Vesicles:rosburia衍生的细胞外囊泡通过调节肠道屏障、微生物组和炎症反应改善结肠炎
该研究揭示了基于r - ev的治疗方法作为一种安全有效的抗炎治疗方法具有很大的潜力,促进了基于bev的治疗难治性IBD的临床应用。
2024-09-30
Nat Chem Biol : 魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能解析
氨基酸是组成蛋白质的基本单位,其突变可以通过多种方式影响蛋白质功能,进而影响细胞生存和多种疾病的发生发展。此前研究已证明,使用碱基编辑器进行内源性氨基酸替换,并结合细胞筛选来大规模研究其功能的可行性
2024-10-09
Nature子刊:研究发展出复杂体系中可同时鉴定配体靶蛋白质和结合位点的蛋白质组学方法
研究利用蛋白质在结合配体后局部稳定性的变化,开发了在复杂体系中可以同时高灵敏鉴定配体结合蛋白和结合位点的蛋白质组学新方法(PELSA)。
2024-12-27