研究构建出长牡蛎染色体水平基因组和变异图谱
近日,中国科学院海洋所张国范研究组完成的论文Construction of a chromosome-level genome and variation map for the Pacific oyster Crassostrea gigas(《长牡蛎染色体水平基因组和变异图谱构建》),在线发表在Molecular Ec
精神分裂症整合组学研究方面取得进展
精神分裂症(Schizophrenia,SCZ)是一种病因未明的重性精神疾病。SCZ的全球终身患病率约为1%,常发病于青壮年,且不到50%患者能获得较好预后。SCZ的遗传力高达80%,表明遗传风险因素在SCZ中起主要作用。虽然在过去数十年中,精神分裂症全基因组范围内的关联研究(GWAS)鉴别到系列风险遗传变异,但由于遗传异质性和连锁不
PNAS:“实时”转录组学揭示果蝇接种肿瘤细胞后的免疫防御机制
此前研究发现,通过将致癌的RasV12细胞注射到成年雄性果蝇中,会在经过几天的滞后期后大量繁殖,并导致2至3周后果蝇死亡。针对这一现象,来自法国斯特拉斯堡大学的Jules A. Hoffmann团队等人对细胞注射期间的转录组特征进行了研究。相关结果发表在最近的《PNAS》杂志上。
Nat Microbio: 念珠菌感染引发阴道上皮细胞保护性免疫反应以及组织修复的作用机制
阴道念珠菌病(Vaginal candidiasis)是一种极为常见的传染性疾病,主要由以下4中病原体引起:白色念珠菌(Candida albicans);光滑念珠菌(Candida glabrata),副念珠菌(Candida parapsilosis);和热带假丝酵母(Candida tropicalis)。在最近一项发表在《Nature Microbi
Cell Host Microbe:儿童出生及生长阶段内肠道菌群是如何发育的?
众所周知,肠道内存在着以微生物为主的致密生态系统,该生态系统自出生时便已经存在。然而,不同的菌株是何时,以何种方式在肠道中定植的至今仍然未知。在最近发表于《Cell Host Microbe》杂志上的一项研究中,来自瑞典Gothenburg大学的Fredrik Backhed教授等人探究了瑞典境内471名儿童从出生至5岁时肠道的微生物种群变化特征,并且将其与
Mol Cell:剪接因子SF3A3调控致癌基因的翻译水平与癌细胞干性的保持
mRNA剪接是癌症发生过程中十分重要的事件,然而,肿瘤细胞对剪接体成分的选择机制目前尚不清楚。在最近一项研究中,来自瑞典路德大学的Cristian Bellodi教授等人揭示了核心剪接因子SF3A3对于mRNA可变剪接的重要性。在MYC过度激活时,SF3A3水平通过eIF3D调节得到提升。该机制进一步确保了线粒体相关调节子的mRNA的正确剪接。改变的SF3A
JEM:PPARγ调节巨噬细胞的发育
驻留在组织中的巨噬细胞在维持体内稳态中起着至关重要的作用。巨噬细胞祖细胞在围产期迁移到组织中,局部环境随后影响了这些细胞的身份和独特功能。在最近一项研究中,来自瑞士联邦理工学院的科学家们首次表明PPARγ的缺乏会影响新生儿发育,以及影响脾脏中铁回收红髓巨噬细胞(RPMs)和骨髓红细胞生成岛巨噬细胞(EIMs)中VCAM-1的表达。对剩余的少数缺乏PPARγ的
Cell: 研究揭示SARS-CoV-2英国突变株B.1.1.7在美国境内的起源与传播规律
自COVID-19疫情发生至今,已经有多种新型的变异毒株被发现,它们表现出比原始毒株更强的传播力度。其中,一种名为 “501 Y. V1; B.1.1.7” 的毒株携带N501Y突变,该毒株最早于2020年秋季在英国境内出现,之后传播至多个欧洲国家。无独有偶,南非以及巴西境内也鉴定出带有N501Y突变的变异毒株,分别为 “501Y.V2; B.1.351”
Cell Rep:肝脏调节性T细胞如何抑制中性粒细胞介导的自体免疫反应?
此前研究表明,中性粒细胞通过氧化过程,蛋白酶诱导的组织细胞损伤和/或淋巴细胞募集,在各种组织损伤模型(包括慢性炎性疾病)中诱导组织损伤。然而,中性粒细胞也可能具有组织重塑或抗炎特性。Channakeshava Sokke Umeshappa Patricia Solé 6 Bas G.J. Surewaard 6
Immunity:单细胞染色质可读性图谱分析揭示调节性T细胞参与组织修复的分子机制
众所周知,组织中的调节性T细胞(Treg)对于促进组织稳态和再生具有重要作用。在最近一项研究中,来自德国雷根斯堡大学再生医学中心的Markus Feuerer及其团队揭示了健康组织中具有上述功能的Treg细胞的特征。通过研究鼠和人来源的组织特异性Treg细胞的单细胞染色质可阅读性(accessibility),从而定义了一个保守的,不依赖微生物群的组织修复性