Sci Adv:噬菌体的"借东风",中山大学邓音乐团队发现劫持宿主2′,3′-cNMPs信号油门,把自己的DNA插进鲍曼不动杆菌基因组
来源:iNature 2026-07-16 14:08
该研究结果表明,2′,3′-cNMPs是控制鲍曼不动杆菌生物学功能的重要胞内信号分子,而噬菌体可劫持这些信号以促进自身DNA的整合。
核苷酸第二信使广泛参与细菌的生理调节及抗噬菌体免疫。研究表明,2′,3′-环磷酸腺苷/2′,3′-环磷酸鸟苷(2′,3′-cAMP/2′,3′-cGMP)合成酶活性是植物免疫应答所必需的。然而,2′,3′-环核苷酸(2′,3′-cNMPs)是否参与细菌与噬菌体之间的交互作用尚不明确。
2026年6月12日,中山大学邓音乐独立通讯在Science Advances 在线发表题为Bacteriophages hijack 2′,3′-cNMPs to enhance transposase-mediated phage DNA integration in Acinetobacter baumannii的研究论文。
该研究报道,由RnaA合成、并被A1S_2339、A1S_0249及A1S_2666降解的2′,3′-cNMPs在调控鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)的生理功能中发挥关键作用。
2′,3′-cNMPs特异性结合鲍曼不动杆菌中的受体蛋白CRPAb,从而影响CRPAb与靶基因启动子之间的交互作用。此外,本研究揭示,噬菌体通过提高2′,3′-cNMPs水平,上调噬菌体DNA整合所需的转座酶及Mu样整合酶的转录。
综上所述,作者的结果表明,2′,3′-cNMPs是控制鲍曼不动杆菌生物学功能的重要胞内信号分子,而噬菌体可劫持这些信号以促进自身DNA的整合。

核苷酸第二信使(NSMs)是一类细胞内信号分子,在原核生物和真核生物中广泛用于响应细胞外信号或环境线索。这些分子由核苷酸前体产生,并在细胞调控中发挥关键作用。已发现多种NSMs在细菌中控制生物功能,包括生物膜形成、运动性和毒力。
近期研究表明,双-(3′-5′)环二鸟苷酸(c-di-GMP)通过调节含聚脯氨酸蛋白质的翻译,从而控制鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)的生理和毒力,该菌是一种常见的引起院内感染的病原体。此外,3′,5′-环腺苷酸(3′,5′-cAMP)和鸟苷五磷酸((p)ppGpp)在调控鲍曼不动杆菌生理和毒力中的作用也已得到充分证实。
在NSMs中,2′,3′-环核苷酸单磷酸(2′,3′-cNMPs)已在植物、哺乳动物(包括人类)以及微生物中被鉴定。在植物中,2′,3′-环腺苷酸(2′,3′-cAMP)/2′,3′-环鸟苷酸(2′,3′-cGMP)由核苷酸结合富含亮氨酸重复序列免疫受体的Toll/白细胞介素-1受体(TIR)结构域生成,该结构域水解RNA/DNA,并由负调控因子NUDT7降解。
在哺乳动物中,2′,3′-cAMP可能通过核糖核酸酶(RNase)催化的RNA转磷酸化反应生成,并通过环核苷酸磷酸二酯酶降解为2′-AMP和3′-AMP。在大肠杆菌(Escherichia coli)中,2′,3′-cNMPs由RNase I催化的RNA降解产生,并可被含有HD结构域、DHH结构域和钙调磷酸酶样PDE结构域的磷酸二酯酶(PDEs)水解,例如tRNA-NT、YtqI和SpdA。

图1.2 ',3 ' -cNMPs在噬菌体DNA整合过程中的作用分析(摘自Science Advances )
除代谢外,2′,3′-cNMPs的功能也已得到研究。研究表明,2′,3′-cAMP通过其在细胞外降解为腺苷,在哺乳动物中发挥保护器官免受损伤的作用。在植物中,2′,3′-cAMP促进应激颗粒的形成。
此外,2′,3′-cNMPs被认为参与调控细菌的生理和毒力。近年来,已有充分证据表明,NSMs与包括动物、植物和细菌在内的广泛生物体中的先天免疫应答相关,且据报道2′,3′-cAMP/cGMP参与植物免疫应答,因为2′,3′-cAMP/cGMP合成酶活性是TIR介导的细胞死亡所必需的。然而,目前尚不清楚2′,3′-cNMPs是否与细菌免疫相关。
在本研究中,作者发现鲍曼不动杆菌通过环腺苷酸受体蛋白A1S_1479(CRPAb)产生并利用2′,3′-cNMPs来控制其生物功能和毒力。对2′,3′-cNMPs的感知增强了CRPAb与其靶基因启动子的结合亲和力。
值得注意的是,作者发现噬菌体感染增加了细胞内2′,3′-cNMPs的水平,并利用这些信号调控原噬菌体蛋白A1S_1154的表达,最终增强了噬菌体DNA整合。
综上所述,作者的研究结果揭示了2′,3′-cNMPs在控制细菌生理和致病性以及介导噬菌体DNA整合过程中的双重功能。
参考消息:https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.aec7770
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