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Science:从结构上揭示布氏锥虫RNA编辑机制

  1. gRNA
  2. RNA编辑
  3. 布氏锥虫
  4. 编辑体

来源:生物谷原创 2023-07-24 13:35

作为美国波士顿大学的分子生物学家和夫妻,Ruslan Afasizhev和Inna Afasizheva已经合作了几十年。他们共同发表了数十篇关于单细胞致病寄生虫---布氏锥虫

作为美国波士顿大学的分子生物学家和夫妻,Ruslan Afasizhev和Inna Afasizheva已经合作了几十年。他们共同发表了数十篇关于单细胞致病寄生虫---布氏锥虫(Trypanosoma brucei)---线粒体DNA和RNA机制的论文。如今,在一项新的研究中,他们详细介绍了一种叫做RNA编辑的神秘过程,并可能有助于治疗一种致命疾病。相关研究结果发表在2023年7月7日的Science期刊上,论文标题为“Structural basis of gRNA stabilization and mRNA recognition in trypanosomal RNA editing”。

在这篇论文中,Afasizhev和Afasizheva与美国加州大学洛杉矶分校、加州大学欧文分校和中国上海科技大学的合作者一起,首次确定了容纳向导RNA(guide RNA, gRNA)链并允许gRNA链与mRNA接触的分子机器的结构。

确定这些细胞机制可能为科学家们提供治疗非洲昏睡病(一种由布氏锥虫引起的疾病)的重要信息。非洲昏睡病由携带这种寄生虫的采采蝇传播,通常是致命的,许多现有的治疗方法都存在安全隐患,因此分子研究对药物开发尤为重要。

Afasizheva说,“如今我们可以开始更广泛的研究了。因为如今我们确切地知道了蛋白如何与 RNA 相互作用。”

Afasizhev说,“如果我们能找到抑制这种RNA编辑过程的方法,就能在不伤害人体细胞的情况下杀死这种寄生虫。”

RNA 研究取得了巨大的发展和进步,研究细胞内部的技术也是如此。如今,这对夫妇的团队使用低温电镜和分子方法来详细了解 RNA 编辑。

利用这种技术,这项新的研究发现一种名为“编辑体(editosome)”的蛋白复合物负责协调由 gRNA 引导的变化,这些变化以一连串尿嘧啶插入和缺失的形式发生。在布氏锥虫体内,RNA 编辑有一个重要作用:修复断裂的基因。DNA中的突变在这种寄生虫中非常常见,因此即使遗传密码无法读取,经过编辑的 mRNA 也能成为细胞的一个功能部分。

图片来自Science, 2023, doi:10.1126/science.adg4725

在几乎所有拥有细胞核和线粒体的有机体中,RNA 编辑能够调节许多细胞过程。但是,Afasizhev说,不同有机体的RNA编辑机制没有任何共同之处,这意味着这些机制是为不同物种的不同目的而进化的。正因为如此,布氏锥虫的RNA编辑机制才成为阻止这种寄生虫致病的一种有吸引力的治疗靶标,因为它不会干扰人体细胞。既然他们知道了布氏锥虫中 RNA 编辑所特有的蛋白结构,下一阶段的研究工作就是确定在细胞中引发这些反应的酶。

Afasizheva说,“下一个问题是这些反应是如何发生的,这些酶是如何到达底物的,以及它们是如何创造出改变RNA序列的奇迹的。”

她和Afasizhev希望吸引更多的学生来他们的实验室,他们可以接受自己领域的技术进步,并像他们一样继续解决这个复杂的难题。(生物谷 Bioon.com)

参考资料:

Shiheng Liu et al. Structural basis of gRNA stabilization and mRNA recognition in trypanosomal RNA editing. Science, 2023, doi:10.1126/science.adg4725.

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