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Nat Metab:克罗恩病的真菌“保护者”,中山大学左涛等发现球孢枝孢霉菌通过诱导抗菌肽表达抑制肠道炎症

  1. 克罗恩病(CD)
  2. 球孢枝孢菌
  3. 肠道真菌群落

来源:iNature 2026-01-16 16:27

该研究通过克罗恩病的肠粘膜真菌群落谱揭示了球孢枝孢菌的AMP介导的抗炎作用。

克罗恩病(CD)是炎症性肠病的一种亚型,最常影响末端回肠,并与异常的肠道微生物组组成有关。然而,小肠粘膜的真菌及其代谢功能,特别是保护功能,在很大程度上仍未被研究。

2026年1月7日,中山大学左涛、澳大利亚新南威尔士大学Emad M. El-Omar、暨南大学张芬、四川大学张虎共同通讯在Nature Metabolism(IF=20.8)在线发表题为Gut mucosal mycobiome profiling in Crohn’s disease uncovers an AMP-mediated anti-inflammatory effect of Cladosporium sphaerospermum的研究论文。该研究通过克罗恩病的肠粘膜真菌群落谱揭示了球孢枝孢菌的AMP介导的抗炎作用。

该研究描绘了小肠真菌群落的组成和功能景观,并确定了CD肠粘膜中的真菌特征。此外,还揭示了一种有益的真菌,球孢枝孢菌,并证明了其防止肠道炎症的机制。考虑到使益生菌易于在肠道中定殖的困难以及当前IBD治疗管道中缺乏小分子药物,球孢枝孢菌的粘膜定殖、隐窝嗜性性质使其成为进一步开发可行的IBD疗法的有前途的真菌候选物。

CD是炎症性肠病(IBD)的一种重要亚型,其特征是胃肠道的慢性间歇性炎症。尽管CD的发病率在世界范围内不断增加,但CD的病因学和预防措施仍不明确。随着环境和人类生活方式的改变,CD被认为是由对肠道微生物群失调的免疫反应失调引起的。

众所周知,许多细菌在CD患者的肠道中富集,并在引发肠道炎症中起着因果作用。然而,对肠道微生物群的真菌群落(真菌群落)的了解明显不足,特别是在肠粘膜水平,考虑到CD是一种广泛的粘膜疾病。尽管少数研究表明,真菌病原体可以加剧肠道炎症,但在了解粘膜常驻真菌的物种配置和代谢功能方面仍存在相当大的差距,特别是对于可能在粘膜屏障上提供保护功能的共生物种。

先前对IBD肠道真菌群落的研究主要集中在粪便部分,并揭示了粪便真菌群落的扭曲。然而,粪便真菌仅作为腔内容物的替代物,并不能实际反映胃肠道中原位粘膜定殖的真菌群落。

鉴于粪便和粘膜在pH值和氧浓度、代谢物和营养物方面的生理差异,预计肠粘膜真菌群落在组成和功能上不同于粪便真菌群落,并在胃肠道的生理和病理中起着至关重要的作用。鉴于CD是一种胃肠道炎症性疾病,主要影响胃肠道的小肠,特别是回肠末端,阐明CD患者小肠粘膜真菌群落的组成和功能至关重要。

CD粘膜真菌群落明显扭曲,并随疾病活动而变化(图源自Nature Metabolism

该研究招募了来自三个独立队列的CD患者和健康个体,并对回肠粘膜分枝菌群落和细菌组以及粪便分枝菌群落、细菌组和代谢组进行了多组学分析。研究发现,与健康粘膜相比,球孢枝孢菌在CD患者的粘膜中明显减少,但在粪便中保持不变。
随后的因果关系研究表明,球孢枝孢菌占据了肠隐窝生态位,并部分通过腺苷5′-磷酸(AMP)的产生来对抗肠道炎症,如在小鼠、体外和真菌培养物中所证实的。从机制上讲,球孢枝孢菌上调上皮细胞连接和Wnt信号通路。该研究揭示了一种粘膜相关的有益真菌,提示了CD潜在的新的微生物干预策略。
 

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s42255-025-01420-9#Sec41

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