Sci Adv:广州医科大学翁桁游等团队合作发现Nat10调控协调造血干细胞祖细胞的命运决定的新机制
来源:iNature 2026-01-22 15:03
该研究结果表明,Nat10通过ac4C依赖的转录因子翻译调控来协调造血过程,从而建立了一个对HSC维持和功能至关重要的表观转录组-转录组调控轴。
表观遗传调控对于平衡造血干细胞(HSC)的自我更新与分化、从而维持造血稳态至关重要。尽管Nat10介导的RNA ac4C修饰已被证实参与恶性造血过程,但其在正常造血中的作用尚不清楚。
2026年1月7日,广州医科大学翁桁游和中山大学黄慧琳共同通讯在Science Advances 在线发表题为Nat10-mediated ac4C epitranscriptomics orchestrates hematopoietic stem/progenitor cell fate determination via translation control的研究论文。
该研究开发了ULAC-seq技术,以绘制稀有造血干细胞/祖细胞(HSPC)中的ac4C修饰图谱,揭示了动态且具有细胞类型特异性的ac4C修饰模式,该修饰在巨核细胞-红系祖细胞(MEP)中达到峰值,并与Nat10表达水平升高相关。敲除Nat10会破坏HSC的自我更新能力并阻滞MEP分化,导致胚胎期及出生后造血功能衰竭。
从机制上讲,Nat10将ac4C修饰沉积在编码关键造血转录调控因子(例如Nfix)的信使RNA(mRNA)上,从而增强其翻译效率。Nat10缺失会降低Nfix蛋白水平,并抑制其调控HSPC命运的靶基因(例如Mpl)的表达;而重建Nfix表达则可挽救Nat10缺失型HSPC的集落形成缺陷。总之,该研究结果表明,Nat10通过ac4C依赖的转录因子翻译调控来协调造血过程,从而建立了一个对HSC维持和功能至关重要的表观转录组-转录组调控轴。

造血干细胞(HSCs)通过自我更新与谱系特异性分化之间的精密调控平衡,维持终生的血液生成。这一层级化过程始于HSC向多能祖细胞(MPPs)的分化,随后定向分化为谱系特异性祖细胞,包括共同髓系祖细胞(CMPs)、粒细胞-巨噬细胞祖细胞(GMPs)、巨核细胞-红细胞祖细胞(MEPs)以及共同淋巴祖细胞(CLPs)。
RUNX1、PU.1、GATA1和GATA2等转录因子(TFs)是此调控过程的核心,它们通过激活或抑制谱系特异性基因程序来调控HSC的维持与分化。新近证据表明,转录因子在蛋白质水平的定量调控最终决定了造血干/祖细胞(HSPCs)的命运抉择。然而,调控转录因子蛋白质丰度的机制仍知之甚少。
除转录调控外,RNA修饰已成为造血过程中基因表达的关键调控因子。例如,N6-甲基腺苷(m6A)的“写入”蛋白METTL3和METTL14、“擦除”蛋白ALKBH5以及包括YTHDF2、YTHDF3、YTHDC1和IGF2BP2在内的“阅读”蛋白,通过影响mRNA稳定性、翻译及microRNA加工,参与调控HSC命运和造血分化。尽管取得了这些进展,其他类型RNA修饰在正常造血中的作用在很大程度上仍未得到探索。

模式机理图(图片源自Science Advances )
N4-乙酰胞苷(ac4C)是存在于tRNA、核糖体RNA(rRNA)和mRNA上的唯一RNA乙酰化修饰,由N-乙酰转移酶10(NAT10)催化形成。近期研究报道,Nat10介导的ac4C通过调控核心多能性因子OCT4、染色质伴侣ANP32B或核受体NR2F1的mRNA稳定性,在人胚胎干细胞的自我更新、谱系分化及多能性重编程中发挥关键作用。
此外,本课题组先前研究表明,NAT10介导的mRNA ac4C修饰可促进丝氨酸转运蛋白SLC1A4以及转录调控因子HOXA9和MENIN的翻译,从而对白血病的发生及白血病干细胞的维持至关重要。然而,Nat10与ac4C在HSC及正常造血中的作用尚不清楚。
本研究开发了一种名为超低起始量乙酰化RNA免疫沉淀测序(acRIP-seq)的高灵敏度测序方法(ULAC-seq),该方法仅需纳克级输入RNA,可用于绘制小鼠HSPC各层级中的ac4C表观转录组图谱。作者借此揭示了HSPC中存在动态变化的ac4C表观转录组。
进一步研究发现,Nat10介导的ac4C通过调控关键转录因子(如Nfix)的蛋白质水平,在HSPC的维持与分化中扮演关键角色。总之,该研究确立了ac4C作为转录因子驱动的造血稳态的关键表观转录组调控因子,从而将RNA乙酰化修饰与HSC命运决定联系起来。
原文链接:
https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.ady0301
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