大豆基因组解析研究取得进展
来源：东北地理所 2021-07-14 12:11
中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员冯献忠课题组等选择1份东北野生大豆、7份我国代表性栽培种，结合平均50×的三代测序和Hi-C测序，组装了高质量大豆参考基因组。组装的8个大豆基因组大小范围为986.1-1001.3Mb，Contig N50=1.4-6.1Mb，BUSCO完整性评估为96.7%-97.3%；结合同源注释、从头注释
中国科学院东北地理与农业生态研究所研究员冯献忠课题组等选择1份东北野生大豆、7份我国代表性栽培种，结合平均50×的三代测序和Hi-C测序，组装了高质量大豆参考基因组。组装的8个大豆基因组大小范围为986.1-1001.3Mb，Contig N50=1.4-6.1Mb，BUSCO完整性评估为96.7%-97.3%；结合同源注释、从头注释、转录组辅助注释，在8个大豆中注释得到57286-58392个基因。
基于8个高质量的大豆基因组，研究团队鉴定到186-427万个SNP，44-92万个InDel，11750-25330个大的InDel，706-3006个易位事件，200-413个倒位事件。在野生大豆中鉴定到60个栽培大豆中缺失或变短的基因，以及野生大豆种质缺失或变短却在栽培中存在的185个基因。
相关研究成果以Eight soybean reference genome resources from varying latitudes and agronomic traits为题，发表在Scientific Data上。该研究为大豆结构变异与遗传育种研究提供了新的参考基因组。研究工作得到国家重点研发计划、中科院重点研究项目、山东省“泰山学者”项目等的资助。(生物谷Bioon.com）
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