Gut Microbes：减肥手术后微生物群的改变与一致性

减肥手术导致肠道微生物区系发生显着变化，这可能有助于减肥和新陈代谢的益处。这项研究的目的是利用新的和现有的肠道微生物区系序列数据来表征Roux-en-Y胃旁路(RYGB)手术后的微生物特征。作者从RYGB手术患者的粪便样本中提取了16S rRNA基因和元基因组序列(其中61例为16S rRNA基因，135例为元基因组学)，分别在术前基线和术后1、6、12个月测得。作者将这些数据与三个较小的可公开获得的16SRRNA基因和一个来自同样接受RYGB手术的患者的元基因组数据集进行了比较。线性混合模型和机器学习方法被用来检查在不同研究中是否存在共同的微生物特征。将新序列与以前的纵向研究进行比较，发现在多个数据集的术后早期，粪便微生物区系组成(r=0.41±0.10；p<0.05)和代谢途径(r=0.70±0.05；p<0.001)都非常相似。值得注意的是，手术后韦氏杆菌、链球菌、双歧杆菌、梭杆菌、大肠杆菌/志贺氏菌和阿克曼氏菌增加，而布鲁氏菌减少。该研究揭示了RYGB手术后早期在不同研究和地点涉及许多共生和致病的类群和代谢途径的强有力的微生物特征。表征这种强健的微生物特征对减肥手术结果的影响可以为基于微生物组的干预措施的发展提供洞察力，以预测或改善手术后的结果。

原文链接：https://doi.org/10.1080/19490976.2021.1930872

减肥手术是治疗严重肥胖症的最有效的治疗方法，可以快速持久地减轻体重，改善或解决许多与肥胖相关的并发症，包括II型糖尿病和心血管疾病。减肥手术后有助于减肥和新陈代谢改善的机制包括改变饮食、激素、胆汁酸、能量代谢和肠道微生物群。最近的文献表明，减肥手术后肠道微生物菌群的组成和功能发生了显著的变化，这可能是其有益效果的部分原因；然而，这些效果的潜在机制仍不清楚。

为了阐明肠道微生物群发挥有益作用的潜在机制，几项研究评估了减肥手术如何改变肠道微生物群。虽然这些研究确定了随着手术的反应而改变的分类群，但所有研究报告的特定微生物群变化都是不一致的。例如，在减肥手术后，phy- lum Bacteroidetes、Faecalibacterium和双歧杆菌species的相对丰度都有增加和减少的报道。这些差异可能是由于研究组之间的研究设计不同(例如，人口统计学、地理位置、排除和纳入标准、样本量和饮食摄入量)或实验室技术(例如，DNA提取和测序平台)的差异造成的。在肥胖和结直肠癌等领域，先前的荟萃分析已经整合了多项研究中的微生物组数据，以解决肠道微生物组和健康协变量之间的强大关联。这类研究将一致的生物信息学工具和统计模型应用于所有数据集，以消除调查之间的分析变异性，并在可能的情况下模拟研究设计和方法因素对结果的影响。然而，目前还没有这样的荟萃分析来澄清肠道微生物群的变化与RYGB手术结果之间是否存在一致的关联。

属水平上的几个分类群在数据集中一致地增加或减少

原文链接：https://doi.org/10.1080/19490976.2021.1930872

在这项研究中，作者从接受Roux-en-Y胃旁路(RYGB)手术的患者的粪便样本中产生了16S rRNA基因序列和元基因组数据，并将作者研究中观察到的微生物特征与三个公开可用的16S rRNA基因数据集和一个从类似RYGB-微生物区研究中获得的元基因组数据集进行了比较，同时控制了测序和生物信息学工具。作者的研究显示，不同人群中的许多患者的微生物群落对手术的反应非常相似。建立这种一致的微生物特征是开发强大的临床工具的必要前提，这些工具可以利用微生物的变化来预测减肥手术的个性化结果。（生物谷 Bioon.com）

参考文献

Farnaz Fouladi et al. A microbial signature following bariatric surgery is robustly consistent across multiple cohorts. Gut Microbes. Jan-Dec 2021;13(1):1930872.