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Cell子刊解读!科学家们深挖抗体谱寻找治疗SARS-CoV-2之法!

来源:本站原创 2020-11-22 21:51

2020年11月23日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇刊登在国际杂志Cell Host & Microbe上题为“Mining the Antibody Repertoire for Solutions to SARS-CoV-2”的综述文章中,来自宾夕法尼亚大学等机构的科学家们通过对来自重症COVID-19患者机体的抗体谱进行测序揭示了在更大的多克隆应答背景下这些抗体潜在的趋同特征,研究者指出,随着数据库的不断更新改进,未来科学家们或许有可能在感染或疫苗接种后利用抗体测序技术来监测病毒特异性B细胞的水平。

这项研究中,研究者Nielsen及其同事对13名经PCR确诊且入院治疗的COVID-19患者机体的抗体谱进行分析,该研究的一项重要优势在于,其患者均在多个时间点进行了相关调查,同事还揭示了这些抗体谱如何在患者早期感染阶段发生变化;所有患者均在一个或多个时间点检测到了针对SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合结构域部分(RBD)的特殊抗体,同时研究者通过患者机体的基因组DNA进行测序分析了其机体外周血单核细胞的水平,从而就能提供关于克隆图谱的一般见解,比如多样性和克隆突发大小等,而从RNA角度进行分析的话,研究人员还能为体细胞高频突变分析提供抗体分型和高保真序列,其数据库包括共来自38个样本超过120万个克隆,为了便于比较,研究人员利用来自此前一项研究中的114名健康成年人的对照数据库作为对照组,此外,他们还对选定的样本进行了单细胞策略并获得了抗体重链和轻链读数以用作抗体克隆和特异性分析。

图片来源:medicalgraphics.de

定义SARS-CoV-2的免疫特性对于科学家们而言或许是一大挑战,COVID-19存在相当大的疾病异质性,其在患者机体中所产生的抗体反应也各不相同;全球的研究人员重点集中在研究早期疾病发病上,但如果抗病毒抗体是在机体免疫反应后期获得的话,经过几轮选择和抗体亲和力成熟后,其或许就会变得更具有特性。大多数研究都对患者机体的血液进行了采样,血液中充满大量的B细胞和T细胞克隆,其中大部分与SARS-CoV-2无关,而基于组织的B细胞克隆则与机体循环中的B细胞克隆不同,其可能与疾病更加相关,除了这些困难之外,与中和SARS-CoV-2最相关的抗体在血液中非常不常见,尽管血清中的抗体非常容易检测到,最后,在机体免疫反应中产生的看题往往是私有的,比如一个人机体中或许会产生应对病毒的免疫解决性策略,而并不是一定要产生一种能阅读“教科书”的抗体。

当相关研究开始时,抗原特异性的SARS-CoV-2抗体序列的公共数据库仍然相当有限,正如研究人员指出的那样,本文研究仅代表了一个起点,同时也是一个与病毒相关序列的有用参考文库,其之间的关系究竟如何,还有待于后期科学家们进一步研究机体应对病毒所产生的免疫反应的特性。为了加快确定SARS-CoV-2最相关的免疫组库特性,研究人员之间就需要共享数据,而研究者Nielsen及其同事的做法堪称典范,他们共享了数据并将不同的数据进行了对比,目前研究人员正在通过联合研究来开发抗原特异性的B细胞和T细胞基序数据库。随着更多数据能够通过公共数据库来获得,不同的研究成果也将会被整合从而提供关于抗原特异性和疾病相关克隆表型的参考文库,相信通过后期科学家们不断深入的研究,他们将会对机体应对SARS-CoV-2所产生的免疫反应有一个更加全面的理解。(生物谷Bioon.com)

参考资料:

Wenzhao Meng,Aaron M.Rosenfeld,Eline T.Luning Prak. Mining the Antibody Repertoire for Solutions to SARS-CoV-2, Cell Host & Microbe (2020) doi:10.1016/j.chom.2020.09.010

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