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Cell Rep:多组学研究揭示HIV-1感染细胞的详细特征和异质性

来源:本站原创 2020-08-05 21:12

2020年8月6日 讯 /生物谷BIOON/ --为了消除HIV感染,在体内阐明HIV-1感染细胞的详细特征和异质性就变得非常重要了,近日,一项刊登在国际杂志Cell Reports上的研究报告中,来自东京大学等机构的科学家们通过研究表示,利用基因修饰的HIV-1来感染造血干细胞移植的人源化小鼠模型或有望在体内揭示产生HIV-1的细胞的多种特性。

图片来源:SATO Kei

文章中,研究人员对HIV-1感染的细胞进行多组学分析,多组学分析能对全面调查分析生物性样本的特征,相关研究结果或有望帮助研究人员开发治疗HIV-1的新型疗法。最新开发的组学技术或许就能作为一种强大的工具来识别HIV-1感染细胞的特征,然而,感染者体内大部分的CD4+ T细胞或许并未被感染,因此,体内大量CD4+ T细胞的转录谱或许并不能反映纯粹产生HIV-1的细胞。

这项研究中,研究人员利用人类造血干细胞移植的人源化小鼠模型进行研究,这种模型能在体内相对稳定的免疫状况下维持人类的白细胞产生,同时还含有复制潜能的HIV-1;研究者利用最近新开发的四种技术来调查病毒的基因组和转录组学特征,研究人员进行了四项分析:1)首先利用微滴数字PCR就能揭示感染的人源化小鼠机体中潜在病毒库的存在;2)连接介导的PCR能够解释HIV-1会优先整合到开放的染色质区域,而整合位点的表观遗传学修饰与病毒产生的关联就揭示了这一点;3)数字RNA测序能够定量体内产生HIV-1细胞中病毒的绝对拷贝数,这就进一步能够识别出病毒感染和未感染细胞之间差异表达的基因;4)单细胞RNA测序能够揭示并且阐述体内产生HIV-1细胞的特性和异质性。

最后研究者强调,据我们所知,本文研究首次描述了产生HIV-1的细胞的多个方面,同时本文研究也首次在体内调查了HIV-1感染细胞的特性和异质性。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

Hirofumi Aso, Shumpei Nagaoka, Eiryo Kawakami, et al. Multiomics Investigation Revealing the Characteristics of HIV-1-Infected Cells In Vivo, Cell Reports (2020). doi:10.1016/j.celrep.2020.107887

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