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Nat Methods:开发出一种用于研究细胞中基因相互作用机制的新型技术

  1. scHOT
  2. 基因互作
  3. 小鼠
  4. 神经发育
  5. 靶点

来源:本站原创 2020-07-19 23:08

2020年7月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自悉尼大学等机构的科学家们通过研究揭示了细胞发育的命运机制;随着细胞发育,其基因之间相互作用所发生的改变就会决定细胞的命运,这些基因相互作用之间的差异就能够让细胞更加健壮并应对来自病毒的感染,同时也能促进机体免疫细胞来杀灭癌变细胞。图片来

2020年7月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自悉尼大学等机构的科学家们通过研究揭示了细胞发育的命运机制;随着细胞发育,其基因之间相互作用所发生的改变就会决定细胞的命运,这些基因相互作用之间的差异就能够让细胞更加健壮并应对来自病毒的感染,同时也能促进机体免疫细胞来杀灭癌变细胞。

图片来源:Springer Nature/University of Sydney

理解这些基因之间的关联如何在人类组织和器官发育过程中发挥作用,对于开发新型疗法治疗一系列人类疾病至关重要,比如癌症、发育障碍或心脏病等。文章中,研究人员开发了一种新型的单细胞RNA测序技术,其能帮助研究者以前所未有的分辨率来研究人类和哺乳动物细胞中的基因行为,从而就有望加速科学和医学研究发现。

研究者开发了用于单细胞测序的新型分析方法,其能帮助检测人类组织中基因行为的大量改变,该技术被称之为单细胞高阶测试(scHOT,single-cell higher-order testing),研究人员通过鉴定胚胎肝脏发育过程中发生细胞变异的小鼠机体中的基因,证明了该技术的有效性。研究者Jean Yang教授说道,我们发现了一对新型的基因对,其能在小鼠嗅球的表达中发生共同变化,而嗅球是用来理解神经发育疾病的重要组织。

研究结果表明,scHOT技术活能作为一种强大的新型工具来帮助解释隐藏在细胞中的基因关联,并能帮助科学家们利用先进的单细胞技术进行更为深入的研究,本文研究还能帮助识别出机体细胞中潜在的基因靶点,从而就为分析和描述机体的生物学复杂特性提供了新的方法。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

Ghazanfar, S., Lin, Y., Su, X. et al. Investigating higher-order interactions in single-cell data with scHOT. Nat Methods (2020). doi:10.1038/s41592-020-0885-x

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