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J Med Virol:大规模的荟萃分析揭示新型冠状病毒的基因组序列特性

  1. 基因组
  2. 新型冠状病毒
  3. 测序
  4. 编码蛋白
  5. 药物

来源:本站原创 2020-02-08 23:58

2020年2月9日 讯 /生物谷BIOON/ --迄今为止,对新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组进行最大规模的测序分析结果证实,这种病毒起源于蝙蝠,且病毒的异质性较低;近日,一项刊登在国际杂志Journal of Medical Virology上的研究报告中,来自博洛尼亚大学的科学家们通过研究在病毒的蛋白质中鉴别出了一种高度可变的基因组热点区域,该区

2020年2月9日 讯 /生物谷BIOON/ --迄今为止,对新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组进行最大规模的测序分析结果证实,这种病毒起源于蝙蝠,且病毒的异质性较低;近日,一项刊登在国际杂志Journal of Medical Virology上的研究报告中,来自博洛尼亚大学的科学家们通过研究在病毒的蛋白质中鉴别出了一种高度可变的基因组热点区域,该区域主要与两种病毒亚型存在有关。

图片来源:University of Bologna

世界卫生组织数据显示,截至目前(新闻更新时间点)新型冠状病毒已经感染了28276名个体,其中有565人死亡,这项研究中,研究人员对来自世界各地56株冠状病毒的基因组信息进行了分析,其中包括从意大利罗马Lazzaro Spallanzani医院传染病病房的两名中国患者机体中提取的毒株的基因组,这也是迄今为止对新型冠状病毒最全面的研究分析。

研究者表示,这种病毒可能源于一种人畜共患病原体,其最近的亲属最近才被研究人员分离得到,即研究人员在中国云南省的一种菊头蝠体内发现的冠状病毒序列EPI ISL 402131相匹配;人类新型冠状病毒基因组与其蝙蝠“亲属”至少有96.2%的相同之处,而与SARS的相似度则仅有80.3%。

研究者发现,目前所有的冠状病毒的DNA序列都非常相似,即使他们来自于中国不同地区和世界各地,但自从疫情爆发以来,研究人员从患者机体中分离到的病毒的基因组序列则均有99%以上的序列相同,这就表明,这种病毒显示出了较低的异质性和变异性,这似乎是一个好消息,由于病毒的种类相同,因此潜在的治疗性药物被认为对每个人都更加有效。

然而,这项研究中,研究人员在病毒蛋白中首次鉴别出了一个高度可变的热点区域,最终确定了两种病毒亚型,其二者的区别仅在于一个氨基酸,其能够改变ORF8编码蛋白的序列和结构,ORF8编码蛋白是一种尚未被鉴定的病毒成分。(生物谷Bioon.com)

原始出处:

Carmine Ceraolo,Federico M. Giorgi. Genomic variance of the 2019‐nCoV coronavirus, Journal of Medical Virology (2020). DOI:10.1002/jmv.25700

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