报名|2019年西藏民族大学-复旦大学“生命组学大数据分析及能力提升”暑期课程班
来源：医传网 2019-05-28 10:52
暑期课程班一、背景在精准预测、精准预警、精准医疗大背景下，随着基因分型、新一代测序、传感和图像技术的发展与成熟，产生了海量的基因组数据（包括各类常见和罕见变异、insertion/deletion、CNVs等）及转录组、表观基因组、图像、生理生化、临床信息等一系列表型组数据（包括RNA-seq、methylation-seq 和 Chip-seq等），使得大数据分析成为当前研究多基因复杂疾病易感性
暑期课程班
一、背景
在精准预测、精准预警、精准医疗大背景下，随着基因分型、新一代测序、传感和图像技术的发展与成熟，产生了海量的基因组数据（包括各类常见和罕见变异、insertion/deletion、CNVs等）及转录组、表观基因组、图像、生理生化、临床信息等一系列表型组数据（包括RNA-seq、methylation-seq 和 Chip-seq等），使得大数据分析成为当前研究多基因复杂疾病易感性、复杂疾病的发生机制和疾病防治研究与药物开发的关键技术，是基因组医学自主创新的重要条件。因为通过对不断增加的、越来越复杂多样的基因组、表观基因组及生理和解剖数据的分析将为整体解析疾病的遗传和表观遗传结构提供珍贵的信息，同时也将为提高疾病的诊断、预测临床结果、了解疾病进展特征、增强健康管理和精准医疗提供基础。
本暑期课程班将提供对日益增加的、复杂多样的基因组、表观基因组及生理和图像大数据分析的统一标准框架、基础知识和有效的算法工具，并展示多变量分析到功能数据分析、关联分析到因果分析、低解析度数据到高解析度数据、单个基因组/表观基因组/生理/图像/临床到多个整合的数据分析的全套解决方案。
课程设计通过真实数据和案例分析来介绍目前统计方法、计算算法和软件的发展，以满足当前对规模越来越大的复杂基因组、表观基因组数据统计分析培训的巨大需求。为此在西藏民族大学----学院和复旦大学现代人类学教育部重点实验室的共同支持下举办本次暑期课程班，旨在满足这种需求并为国内外基因组/表观基因组大数据分析、统计遗传学领域的专家学者、计算系统生物学家、从事复杂疾病遗传易感性研究和预防统计的专业人员、生物信息科学工作者、研究生提供一个互相交流的平台，也为今后的项目交流和相互合作创造条件。
因此本暑期课程班的目的是：
促进复旦大学和各国大学、研究所的国际合作；
为研究人员/学生与外国专家互动交流提供一个宝贵的平台；
提供文化交流和跨文化学习的独特机会。
本期暑期课程班将采取中英文授课，专门增加实例操作，并对来自海外的国际学员开放。
二、时间和地点
2019年7月5日~7月11日
陕西 咸阳
三、报道和学习
报道时间：2019年7月4日
报到地点：咸阳燕原宾馆大堂（陕西咸阳市渭城区毕塬东路5号）
上课地点：西藏民族大学医学院学术报告厅（四楼）
上机地点：西藏民族大学信息工程学院计算机中心（二楼）
四、日程安排
7月5日上午：
开幕式：西藏民族大学校领导/学院、复旦领导致辞
特邀报告（金力/卢大儒）
Association studies for next-generationsequencing (NGS)
1) Heritability calculation： fromGWAS to NGS (Yin Yao)
2) A multivariate analysis forsub-domains of ASD (Autistic disorders) (Yin Yao)
3) Exploring genetic overlap betweenSchizophrenia and obsessive compulsive disorder (Yin Yao)
7月5日下午：
专题：基因组数据理论方法培训与研讨
1.群体遗传结构对关联分析的影响（何云刚）
2.群体基因组学与基因定位研究（徐书华）
7月5日晚上：上机实习 Plink and C (李明睿、乔春红、王一)
7月6日上午：
特邀报告（康龙丽）
Big Data Analysis in Precision Medicine
1) Discovery of novel driver genesimplicated in esophageal cancer (Yin Yao)
2) Genetic Analysis of Anti-depressant effect (Yin Yao)
7月6日下午：
专题：基因组数据理论方法培训与研讨
1. 比较基因组学和分子进化中的统计分析方法（谷迅/苏志熙）
2. 机器学习（王一）
7月6日晚上：上机实习（苏志熙，王一）
7月7日上午：
特邀报告（王文静）
1) 精准医学研究设计与统计分析方法/组学大数据分析中的因果推断方法（薛付忠）
7月7日下午：
专题：基因组/转录组数据理论方法培训与研讨
1. 理解复杂的转录组：从头到尾(倪挺)
2. 人体共/寄生菌群的微进化研究方法（周雁）
7月7日晚上：上机实习（倪挺、周雁、王一）
7月8日上午：
特邀报告（王久存）
1) ChIP-Seq数据分析（陆晨琪）
7月8日下午：
专题：基因组数据理论方法培训与研讨
1.人类群体中正向选择信号的检测（汪思佳）
2. 技术报告（安捷伦）
7月8日晚上：上机实习甲基化质控 (李明睿、乔春红、王一、安捷伦)
7月9日 实习与考察
7月10日 离会
五、特邀报告人
1.金力，博士、复旦-浩青特聘教
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