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真双子叶植物基部类群叶绿体基因组研究获进展

  1. 叶绿体基因组

来源:武汉植物园 2017-09-28 12:55

 毛茛目星叶草科仅包含星叶草和独叶草两个东亚特有种,星叶草是一年生小草本,茎细弱,高3一10厘米,根直伸,支根纤细。花期5---6月,果期7--9月。零星分布于陕西南部、甘肃中部、青海南部、云南、四川、西藏等地。星叶草为单种属植物,星散分布于我国西北部至西南部。由于森林砍伐,破坏了星叶草适宜生长的生态环境,使分布范围日趋缩小这两个种均为国家重点保护植物,它们具有跟裸子植物银杏相似的开放式

 

毛茛目星叶草科仅包含星叶草和独叶草两个东亚特有种,星叶草是一年生小草本,茎细弱,高3一10厘米,根直伸,支根纤细。花期5---6月,果期7--9月。零星分布于陕西南部、甘肃中部、青海南部、云南、四川、西藏等地。星叶草为单种属植物,星散分布于我国西北部至西南部。由于森林砍伐,破坏了星叶草适宜生长的生态环境,使分布范围日趋缩小这两个种均为国家重点保护植物,它们具有跟裸子植物银杏相似的开放式二叉状分枝叶脉脉序,这在被子植物中十分罕见。

为了更好地研究真双子叶植物基部类群叶绿体基因组的进化趋势,中国科学院武汉植物园博士孙延霞对星叶草和独叶草的叶绿体基因组全序列进行了测序、分析,并重建了毛茛目全部共七个科的系统发育关系。他们在星叶草和独叶草叶绿体基因组的大单拷贝区均发现了一个49kb和一个3.5kb的倒置区域;另外,在星叶草叶绿体基因组的反向重复区发现了一段非常罕见的序列重组结构;accD在星叶草叶绿体基因组中完全丢失;在独叶草的叶绿体基因组中,ΨndhA, ΨndhB, ΨndhD, ΨndhH 和 ΨndhK被鉴定为假基因,而ndhC, ndhF, ndhI 和 ndhG则完全丢失。以上特征在所有已报道的真双子叶植物基部类群叶绿体基因组中均为星叶草科所特有。基于叶绿体基因组全序列的毛茛目系统基因组学分析强烈支持星叶草科和木通科的姐妹关系。

该研究是孙延霞在真双子叶植物基部类群叶绿体基因组研究中继发表在Plos One和Molecular Phylogeny and Evolution的研究工作后的又一新的成果。论文正式发表在BMC Genomics(2017 18:592)上。(生物谷Bioon.com)

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