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西农:miRNA参与决定海胆性别

来源:联川生物 2014-03-05 16:06

MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性非编码小RNA,在转录后水平调控基因表达。光棘球海胆(Strongylocentrotusnudus)既是非常好的研究发育的模式生物,又是具有重要商业价值的食物来源。然而,到目前为止还没有报道过miRNAs参与调控S.nudus性腺分化。由西北农林科技大学刘小林教授领衔的团队采用小RNA测序技术对此问题展开深入分析*,研究成果发表在近期的Comparative Biochemistry and Physiology Part D: Genomics and Proteomics上。

刘教授团队首先构建了两个分别来自雄性和雌性S.nudus性腺的小RNA文库并进行高通量测序分析。测序发现,在两个文库中,共有184个miRNAs,包括60个已知的和124个新的miRNAs。研究人员对其中已知miRNA的碱基偏好性和末端变化进行了分析。不仅如此,通过比较两个文库中的miRNA表达谱,发现有67个miRNAs差异表达,它们来自86个共表达和98个性别特异的(47个雄性特异,51个雌性特异)miRNAs,这些差异表达的miRNAs可能参与性别分化。本项研究绘制了第一张S.nudus性腺分化相关的miRNA表达谱。

*Xiao Mi, ZhenlinWei, Zunchun Zhou, Xiaolin Liu Identification and profiling of sex-biased microRNAs from sea urchin Strongylocentrotusnudus gonad by Solexa deep sequencing (2014) Comparative Biochemistry and Physiology, Part D 1-8[article] (生物谷Bioon.com)

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