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AB SCIEX与ISB合作开发用于蛋白质组学研究的质谱分析方法与技术

来源:生物谷 2013-02-21 10:31

美国系统生物学研究所(ISB)和AB SCIEX公司签署了一项多年合作协议,共同开发用于蛋白质组学研究的质谱分析方法与技术,其目的旨在重新定义生物标记研究,并通过全面综合的定量蛋白质组学分析技术完善基因组学,这将有助于推动新型医疗护理方法的开发。

ISB的P4医疗理念有望深入洞察疾病机制,从而开发出可预见、个性化、注重预防和主动参与(4P)的医疗护理方法,这一前沿理念需要综合运用各种分析工具、工作流程、数据库和计算技术。

ISB总裁兼联合创始人Hood博士指出:"P4医疗理念在将科学研究转化为临床效果方面取得了重大突破,有望围绕单独个体创建出由数十亿个数据点组成的虚拟云端,以此作为直接预测健康和疾病的基础。"去年12月,Hood博士荣膺国家科学奖,这是美国总统授予科学家的最高荣誉,表彰其在推动科学进步方面所做的前瞻性工作。

ISB在Hood博士领导下开展的突破性研究在SWATH采集技术支持下将进一步提速。该技术是一种数据非依赖性采集(DIA)的质谱工作流程,在一次分析中即可对复杂样品中所有多肽和蛋白质进行定量。

Hood博士还指出:"同时定量大量蛋白质分析物,也是加速P4医疗理念发展和蛋白质组分析的关键需求,这场革命类似于基因组测序和DNA分析技术。SWATH是一种革命性创新技术,其实就是一种蛋白质微阵列,可以实现完整蛋白质组的全面定量,而且具有很好的重现性。它能提供整个蛋白质组的数字记录,未来几年我们都可以对该数字记录进行回顾性挖掘利用。"

ISB在系统生物学和信息学领域的专业知识将支持SWATH库的开发,如深受好评的、专门针对人类蛋白质组(由Rob Moritz及其同事开发的)的SRMAtlas项目和其它临床相关生物体蛋白质组项目。ISB蛋白质组首席科学家Moritz博士指出:"有了完整的蛋白质组库,ISB为支持全面SWATH分析奠定了坚实的基础。"

ISB致力于数据和方法共享,将为全球科学家提供SWATH数据库,以加速SWATH技术在其它生物研究领域的应用。通过深度蛋白质组技术开发,利用数据解释工具、标准化计划和Moritz博士领导下的数据库开发工作等提供的丰富蛋白质组计算资源的支持,ISB将开发新的SWATH技术和工具,帮助科学界快速推广综合定量蛋白质组分析。

Moritz博士指出:"让不同实验室、不同样品中的蛋白质组数据标准化,使我们真正能够对整个蛋白质组进行定量,这是此前无法企及的。我们旨在定义出能预测病人是否对某种治疗方案有反应的生物标记物,采用SWATH技术能为进一步推动技术向更高层次发展发挥巨大作用。我们现在不仅能扩展基因组学的广度,而且还将推动迫切需要的数据库和软件的开发,进一步简化数据共享,促进标准化。"

作为深受学术研究人员信赖的合作伙伴,AB SCIEX与Hood博士、Moritz博士以及他们出色的ISB同事建立了战略同盟,将通过AB SCIEX学术合作伙伴计划协助推广新技术的应用,让全球范围内研究人员采用新技术进一步深化组学研究。

AB SCIEX的总裁Rainer Blair表示:"ISB采用SWATH开展的工作将建立蛋白质组研究领域的新基准。我们与ISB的合作将推动SWATH技术步入分析科学的主流研究领域,并帮助全球生物学家更轻松地获取全面可重现的简化组学数据。"

ISB将把AB SCIEX TripleTOF 5600+ 系统和Eksigent ekspert? nano-LC 400 系统用作仪器平台,在其上进行蛋白质鉴定与定量分析。TripleTOF 5600+ 系统可为SWATH 采集提供所需的高速度,TripleTOF技术将高采集速度和高灵敏度与高分辨率和高精度质谱完美结合在一起。在未来,ISB还计划采用差分离子迁移领域的最新成果SelexION 技术来推进其研究工作。

关于P4医疗

P4医疗是预见性(Predictive)、注重预防(Preventive)、个性化(Personalized)和主动参与(Participatory)的简称,是在系统生物学、网络化消费者不断增长以及通讯与信息技术数字化革命等多种趋势推动下应运而生的新兴产业。回顾历史,人类生物学就好像是一个黑匣子,除了疾病的表征之外我们所知甚少。而现在,系统生物学开启了这个黑匣子。P4医疗将每个人类个体在时间和空间上视为网络状态的连续统一体,采用系统生物学的首创功能洞察每个个体黑匣子内部情况,生成行之有效的疾病和健康状况信息。

关于系统生物学研究所

系统生物学研究所(ISB)是一家总部设在西雅图的国际著名非营利研究机构,致力于系统生物学的研究与应用。ISB成立于2000年,力求破解人类生物学之谜,同时寻找预测和预防疾病、解决能源和环境问题以及改进K-12科学教育等的策略。ISB的系统方法将生物学、计算和技术开发结合在一起,使科学家能够一次性分析生物系统中的所有元素,而不是每次只分析一种基因或蛋白质。ISB拥有10个部门,约230名员工。如欲了解有关ISB的更多详情,敬请访问:www.systemsbiology.org,或登录Twitter @ISBUSA和Facebook。

关于AB SCIEX

AB SCIEX公司是一家全球性企业,业务遍布世界上31个国家和地区。AB SCIEX公司是生命科学分析仪器技术发展的全球领导者,致力于协助解决复杂的生命科学问题。AB SCIEX公司为生命科学众多领域提供仪器、软件、技术等服务,包括蛋白质生物标志物研究,疾病研究,药物研发,食品安全和环境检测等。AB SCIEX公司拥有近30年辉煌的技术创新历史,是唯一且持续专注于质谱仪器的全球领导者。凭借应用生物系统/ MDS分析技术合资公司20多年的创新历史传承和市场领导地位。

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