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Hepatology:利用RNA干扰技术鉴定HCV复制相关的宿主基因

来源:生物谷 2007-05-25 21:31

生物谷报道:HCV复制高度依赖于宿主的细胞因素。鉴定这些宿主因素不但有助于理解HCV感染生物学,而且有助于发现治疗HCV的新靶点。为了鉴定对HCV RNA复制起重要作用的宿主基因,研究人员筛选了源于Huh7EN5-3细胞中的近4000条人类基因的小干扰RNA库(siRNA),对参与HCV复制的宿主基因进行了鉴定。该研究结果发表在5月的《肝病学》杂志上。

在本筛选中研究人员鉴定了可能调节HCV复制的9条基因。使这些基因沉默可以导致HCV复制减少超过60%,而且细胞毒性降到最低。用这些siRNA敲除宿主基因表达在RNA水平得以证实,有些结果也可在蛋白水平证实。siRNA使宿主基因沉默程度与抑制HCV复制的相关性良好。这些基因包括一种G蛋白偶联受体(TBXA2R)、一种膜蛋白(LTbeta)、一种接头蛋白(TRAF2)、两种转录因子(RelA和核因子κB2),两种蛋白激酶(MKK4SNARK)和两种密切相关的转录蛋白(SLC12A4SLC12A5)的编码基因。有趣的是,这些基因中有部分基因参与了肿瘤坏死因子/淋巴毒素的信号转导通路。

本研究结果为明确HCV复制提供了重要信息。此外,这些细胞的基因可以成为治疗HCV的一系列新靶点。

Figure 1. Organization of subgenomic HCV replicons. Open-reading frames are shown as boxes and nontranslated regions as bars. Replicons contain HCV nonstructural proteins from either genotype 1b (strain N) or genotype 1a (strain H77), as well as HIV tat-FMDV 2a-neomycin cassette (tat-2A-neo), which drives SEAP expression in replicon cells. Positions of amino acid changes introduced to enhance HCV replication are marked (FMDV, foot-and-mouth disease virus; HDV, hepatitis delta virus; EMCV IRES, encephalomyocarditis virus internal ribosome entry site).

 

 

原文出处:

Identification of host genes involved in hepatitis C virus replication by small interfering RNA technology (p NA)
Teresa I. Ng, Hongmei Mo, Tami Pilot-Matias, Yupeng He, Gennadiy Koev, Preethi Krishnan, Rubina Mondal, Ron Pithawalla, Wenping He, Tanya Dekhtyar, Jeremy Packer, Mark Schurdak, Akhteruzzaman Molla
Published Online: 22 May 2007
Hepatology

DOI: 10.1002/hep.21608
Abstract  |  References  |  Full Text: HTML
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背景知识:

#609532

HEPATITIS C VIRUS, SUSCEPTIBILITY TO
HEPATITIS C VIRUS, RESISTANCE TO, INCLUDED
Gene map locus
1q31-q32

 

 

相关基因:

TBXA2R

Official Symbol: TBXA2R and Name: thromboxane A2 receptor [Homo sapiens]

Other Aliases: TXA2-R

Other Designations: prostanoid TP receptor

Location: 19p13.3

Chromosome: 19 Annotation: NC_000019.8 (3557657..3545503, complement)

MIM: 188070

GeneID: 6915

TRAF2

Official Symbol: TRAF2 and Name: TNF receptor-associated factor 2 [Homo sapiens]

Other Aliases: MGC:45012, TRAP, TRAP3

Other Designations: OTTHUMP00000064745; tumor necrosis factor type 2 receptor associated protein 3

Location: 9q34

Chromosome: 9 Annotation: NC_000009.10 (138900785..138940887)

MIM: 601895

GeneID: 7186

 

 

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