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Nat Microbiol:盗用宿主“身份证”,武汉大学陈实/王连荣合作揭示噬菌体如何通过分子模仿骗过细菌的Ssp免疫防线

  1. 细菌Ssp防御系统
  2. 免疫系统(Ssp)
  3. 硫转移酶(IscS)

来源:iNature 2026-08-03 10:13

该研究揭示了一种噬菌体对抗细菌DNA磷硫酰化(PT)修饰免疫系统(Ssp) 的巧妙策略:劫持宿主自身的硫转移酶(IscS),在自身DNA上安装PT修饰,伪装成“自己人”以逃逸识别和切割。

细菌Ssp防御系统通过在宿主DNA中引入序列特异性硫代磷酸酯(PT)修饰(通过SspABCD)并切割未修饰的外源DNA(通过SspFGH或SspE)来区分自我与非自我。

2026年7月29日,武汉大学陈实、王连荣共同通讯在Nature Microbiology(IF=18.7)在线发表题为Phage hijacks host phosphorothioate DNA modification machinery to circumvent bacterial Ssp defences的研究论文。

该研究揭示了一种噬菌体对抗细菌DNA磷硫酰化(PT)修饰免疫系统(Ssp) 的巧妙策略:劫持宿主自身的硫转移酶(IscS),在自身DNA上安装PT修饰,伪装成“自己人”以逃逸识别和切割。

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为抵御噬菌体感染,细菌部署了多样化的免疫系统“武器库”,靶向病毒生命周期的不同阶段。这些包括阻止噬菌体吸附的细胞表面修饰;通过表观遗传标记宿主DNA并切割未修饰外源DNA的限制修饰(R-M)系统;在感染时诱导细胞死亡或生长停滞的流产感染(Abi)机制;以及存档病毒遗传序列以指导后续干扰的CRISPR–Cas适应性免疫系统等。

生物化学和结构分析极大地推进了人们对这些细菌防御机制的理解。例如,在SspABCD–SspFGH和SspABCD–SspE系统中,四个SspABCD蛋白共同介导DNA硫代磷酸酯(PT)修饰。这种修饰涉及糖-磷酸骨架中非桥接氧被硫原子取代,产生PT修饰的序列基序,如5′-CPSCA-3′/3′-GGT-5′。

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PptA介导的噬菌体基因组PT修饰及噬菌体逃避Ssp防御的机制(图源自Nature Microbiology

在这里,研究人员报道PptA—一种噬菌体编码的含[4Fe–4S]簇蛋白—hijacks同源宿主半胱氨酸脱硫酶IscS同源物以组装一套精简的PT修饰机制。整合的生化和结构数据描绘了IscS–PptA复合物内分子间硫转移的模型。在感染时,PptA的强劲表达—不仅仅是其存在—驱动足够的PT掺入噬菌体基因组中,实现对宿主PT模式的分子模拟。

通过伪装为“自我”,修饰的噬菌体DNA逃避了SspFGH/SspE的识别和切割。值得注意的是,PptA可以将Ssp敏感的λ噬菌体重编程为免疫逃逸变体。这些结果揭示了噬菌体克服基于PT的细菌免疫所采用的共进化策略,并为工程化绕过这种广泛防御系统的治疗性噬菌体提供了基础。

参考消息:https://www.nature.com/articles/s41564-026-02387-3

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