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研究通过多任务深度神经网络建立药物调控激酶谱的预测分析方法

蛋白激酶(protein kinases)是细胞功能的关键调节分子,是生物体内最大且功能最多样的基因家族之一。因此,激酶是开发治疗癌症、炎症、糖尿病、心血管疾病和阿尔兹海默症等相关疾病药物的重要靶标。然而,由于激酶家族蛋白质(特别是催化域)结构的高度保守性,给高效选择性激酶抑制剂的开发带来了巨大挑战。二十一世纪以来,随着计算机计算能力的迅猛提升和大数据的涌现,深度学习在机器学习算法的基础上快速崛起

2019-09-08

周环酶催化机制研究取得进展

中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室周佳海课题组和美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)唐奕课题组合作,解析了高分辨率的LepI及其与底物类似物或产物4、5、6的复合物晶体结构,并通过与UCLA的Kendall Houk课题组合作开展理论计算工作,系统地阐释了LepI催化的分子机制。该工作于7月22日在线发表在《自然-化学》(Nature Chemistry)上。周佳海课题组的博士生

2019-08-10

我国科学家揭示HECT型E3连接酶的一种多锁酶活调控机制

  2019年7月18日,复旦大学生物医学研究院/华山医院神经外科温文玉课题组在Nature Communicaitons杂志上发表了题为“A multi-lock inhibitory mechanism for fine-tuning enzymeactivities of the HECT family E3 ligases”的研究工作,该研究揭示了Nedd4家族E3普遍

2019-08-06

英美科学家联合开发转化植物废弃物的工程酶

  来自美国蒙大拿州立大学、美国能源部国家可再生能源实验室、美国加州大学和英国朴茨茅斯大学的英美酶工程团队联合在Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America(PNAS)杂志发表了题为“Enabling microbial syringol conversion th

2019-08-05

酶定向进化方法学研究取得进展

定向进化技术是改造酶催化特性(如立体/区域/化学选择性、活性、热稳定性等)的有效手段。前期研究证明,对位于酶催化口袋的氨基酸残基进行饱和突变(SM)可成功控制酶的选择性和活性。作为常用的简并密码子,NNK可编码20种氨基酸,但随着突变位点的增多,筛选量呈指数级增长(20m,m为位点数目)。如何通过精简密码子设计并构建高效突变体文库,从而克服筛选瓶颈受到越来越多的关注。中国科学院天津工业生物技术研究

2019-08-03

Cell Rep:揭示T细胞中PD-1信号传输的通路

2019年6月26日讯 /生物谷BIOON /——苏黎世联邦理工学院的研究人员发现了免疫细胞过多的的生化信号通路。这一发现对癌症免疫治疗等领域的进展具有重要意义。图片来源:Shutterstock近年来,肿瘤学家在癌症免疫治疗方面取得了巨大成功,尤其是在去年获得诺贝尔医学奖的免疫检查点抑制剂。肿瘤细胞有抑制患者自身T细胞活动的能力,导致T细胞离开肿瘤。为了做到这一点,他们使用了分子"握手",即肿瘤

2019-06-26

Cell Rep:揭示肿瘤和罕见疾病中起关键作用的蛋白质的新功能

2019年6月26日讯 /生物谷BIOON /——由Ana Losada领导的西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的染色体动力学小组在一篇发表于《Cell Reports》的论文中,描述了在老鼠胚胎干细胞中黏连蛋白的新功能,这可能有助于理解和解决这些疾病的原因。黏连蛋白是一种蛋白质复合物,对细胞分裂中的染色体分离至关重要。最近的证据表明,它在三维基因组结构中也起着重要作用,基因组像折纸一样折叠,调节

2019-06-26

蛋白激酶化学生物学研究获进展

 6月14日,中国科学技术大学姚雪彪团队与中国科学院生物化学与细胞生物学研究所张荣光合作团队在Cell Research 发表题为BubR1 phosphorylates CENP-E as a switch enabling the transition from lateral association to end-on capture of spindle microtubules

2019-06-25

Nat Microbiol重磅!人体肠道菌中发现可以将A型血直接转变为O型血的酶!

2019年6月25日讯 /生物谷BIOON /——英属哥伦比亚大学的一个研究小组发现了两种酶,它们可以将A型血转化为O型血。在《Nature Microbiology》杂志上发表的论文中,该小组描述了他们对人类粪便中细菌的元基因组研究以及他们的发现。图片来源:Nature Microbiology人有四种血型:A型、B型、AB型和O型,这些血型不适合输血,但O型除外,它可以被输血给接受者,这使其具

2019-06-25

不容错过的前列腺癌最新研究成果一览!

2019年6月17日讯 /生物谷BIOON /——本期盘点为读者朋友们带来关于前列腺癌的最新研究进展,帮助大家了解关于前列腺癌的发生、发展、转移、诊断、治疗和预后的最新研究成果,希望大家喜欢。【1】eLife:前列腺癌标志物PSA会激活血管和淋巴管生成因子,促进癌症转移DOI: 10.7554/eLife.44478一项新的研究表明,前列腺特异性抗原(PSA)是一种前列腺癌标志物,是激活血管内皮细

2019-06-17