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单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

研究揭示拟南芥RNA聚合酶V的转录延伸机制

Pol V-KTF1转录延伸复合物的冷冻电镜结构显示,Pol V具有和Pol II类似的活性中心,但Pol V活性中心的结构单元和Pol II具有构象差异。

2023-06-06

两篇Cell子刊发现在抗逆转录病毒治疗期间,感染者体内休眠的HIV可产生病毒RNA和蛋白

HIV抗逆转录病毒疗法(ART)被认为是一种治疗方法,而不是一种治愈方法,因为患者通常会携带有感染HIV的细胞库,如果停止治疗,HIV就会重新出现。长期以来,人们一直认为这种细胞库处于休眠状态,但是在

2023-09-23

外泌体长链非编码RNA MLETA1可能作为肺癌诊断和治疗的预后生物标志和潜在的治疗靶点

肺癌是世界范围内最常见、最致命的癌症。非小细胞肺癌(NSCLC)约占所有肺癌的85%,约90%的肺癌相关死亡是由于转移所致。因此,迫切需要阐明肺癌转移的潜在机制,寻找肺癌诊断和治疗的早期生物标志物。

2023-12-05

研究鉴定出小麦穗发育的转录调控因子

为促进小麦穗发育研究和分子设计育种,团队与合作者搭建了小麦穗发育多组学数据库,提供了包括基因信息查询、共表达分析、TRN预测、表观图谱绘制及突变体库检索等模块在内的“一站式”服务。

2024-02-12

科研人员出小麦穗发育的转录调控因子

中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员肖军团队通过结合多维组学、群体遗传学和基因功能解析等研究手段,提出了系统高效鉴定关键调控因子的策略。

2024-02-07

科研人员提出环形RNA全长转录本解析技术

近年的研究表明,环形RNA在真核生物体内具有广泛的生物学功能。由于环形RNA序列与线性RNA相似度高,因此如何高效鉴定环形RNA特有的外显子结构,是环形RNA研究中的重要问题。

2023-04-21

综述:实体瘤空间转录组分析的新见解

空间和时间动力学与细胞生命周期的所有特性密切相关,包括细胞发生、分化、功能和死亡。

2023-10-26

Cell:揭示生长中的细胞加快转录速度的机制

研究者发现,生长中的细胞之所以能产生所需的 RNA,是因为一种名为 RNA 聚合酶 II(RNAPII)的关键酶的可用性在不断增加,而这种酶的可用性会随着细胞大小的增加而增加。

2024-02-29

Nature:细菌cGAS感知病毒RNA并启动免疫防御

这项研究还带来了一些值得进一步探索的重要问题——噬菌体是如何产生cabRNA的,为什么会产生cabRNA,它的作用又是什么?

2023-12-12