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  • 转录组层面上研究蛋白质-RNA相互作用的技术及方法综

    两周前,小编给大家推荐了清华大学张强峰教授在QB期刊上发表的关于转录组层面上研究RNA-RNA相互作用的干湿实验方法的综述文章后(点击这里进入该篇文章),引起了许多小伙伴的关注。并且也有小伙伴问,RNA在转录组层面上的相互作用不仅有RNA-RNA之间的,应该还有蛋白质-RNA之间的相互作用呢!那关于RNA-蛋白质相互作用的研究进展又如何呢?     

  • QB期刊 |转录组层面上RNA-RNA相互作用(RRI)的研究进展及机遇综述

    最近关注CNS的同学们一定对“Phase Separation”这个词相当眼熟。这个单词翻译成中文就是“相变”或“相分离”。对,你没有看错,就是这个物理化学领域的术语。但最近,这个术语在生命科学领域也掀起了“热浪”。因为据不完全统计,从2018年1月到现在,关于该方面的研究已经有20多项工作分别发表在了Science、Nature或Cell上(对这个领域还不知道的同学,赶紧点击这里,先脑补一下哦

  • Gotham成立 表观转录组学进入转化阶段

      10月11日,纽约的Gotham Therapeutics获得5400万美元A轮投资,正式挂牌成立。Gotham的技术平台是表观转录组学(epitranscriptomics)、即调控RNA的化学修饰。Gotham主要关注一种叫做m6A(6-甲基腺苷)的常见mRNA修饰,这个修饰在RNA代谢中起到关键作用、与多种疾病相关。这是继今年五月Accent Therapeutics

  • Science:重大进展!利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性

    2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化,因此染色质可接近性有

  • Science:构建出真涡虫细胞类型转录组图谱

    2018年4月24日/生物谷BIOON/---真涡虫是一类相对简单的动物,具有不同寻常的生物学特征:成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞(progenitor cell)。真涡虫获得人们的大量研究,部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whitehead Institute。在一项新的研究中,来自美国怀特

  • 转录组学研究领域重要研究进展一览

    转录组学,即在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科,近年来,科学家们在转录组学研究领域取得了多项研究成果,本文中,小编对相关重要研究进行整理,分享给大家!【1】Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表doi:10.1016/j.cell.2018.02.001在国家自然科学基金项目等资助下,近日,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳

  • 单个细胞转录组测序成本降至1美分!《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术

     许多疾病,例如阿尔兹海默病和帕金森病,都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因,将有助于了解疾病的病因和进展情况,进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向,但是现有方法价格昂贵,且需要专门的设备,严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日,一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破,有望将单个细胞的测序成本降至

  • 转录组测序数据分析及案例实践班(第四期)

    转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-

  • Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表

     在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱)为题,于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell(《细胞》)

  • 科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间的作用

     近日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组,中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组,与清华大学沈沁研究组合作发表的论文,以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题,在线发表