单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测，并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析，具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature子刊：诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中，研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能，这些数据来自不同的空间技术平台。
2024-04-10
科研人员开发表观转录组数据聚类框架iMVP
iMVP的开发为RNA编辑修饰研究带来了新的可能性，为科研人员提供了一个更全面、更有效的工具，有望有助于更深入地理解RNA编辑修饰的复杂性和功能。
2023-10-13
研究人员利用光催化邻近标记技术揭示应激颗粒转录组动态变化
应激颗粒是在胁迫条件下形成的动态结构，通常认为其中包含翻译被抑制的RNA以及翻译元件，并可在刺激消失后解聚，是细胞内典型的无膜细胞器。
2023-12-04
大鼠和人类胰岛转录组中发现2型糖尿病前期的标志
中国科学院数学与系统科学研究院李雷课题组开发了一种计算方法，对T2D的动物模型Goto-Kakizaki（GK）和对照模型Wistar（WST）大鼠胰岛的时间序列全基因表达谱以及来自捐献者的人类胰岛的
2023-10-11
研究人员开发全基因组检测逆转录转座子的新方法
逆转录转座子（Retrotransposons）在大多数物种中都普遍存在，能够通过“复制-粘贴”机制进行大量扩增，在人类基因组中占比超过35%。逆转录转座子可以为创造新的功能基
2023-11-15
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术，探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
研究鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
为促进小麦穗发育研究和分子设计育种，团队与合作者搭建了小麦穗发育多组学数据库，提供了包括基因信息查询、共表达分析、TRN预测、表观图谱绘制及突变体库检索等模块在内的“一站式”服务。
2024-02-12
Nature：中美科学家联袂揭示启动小鼠合子基因组激活的关键转录因子
在一项新的研究中，来自中国清华大学和美国加州大学戴维斯分校的研究人员发现受精卵细胞---称为合子（zygote）---如何进行“重置”，从而使新形成的胚胎能够按照自己的遗传程序
2023-07-28