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Horticulture Research:植物基因组LTR类转座子分类研究方面取得进展

 转座子是构成基因组重复序列的主要成分。越来越多的研究表明,转座子在决定基因组大小、基因组结构变异、序列突变、基因丢失、基因融合和新编码基因的起源方面,都具有重要的生物学意义。LTR类转座子是植物基因组中占比最高的重复序列类型,它是逆转录转座子的一种。然而目前大部分软件对LTR类转座子仅停留在超科水平(superfamily level),没有提供

2022-02-22

Front Cell Neurosci:逆转录转座子的表达在亨廷顿氏症中或会受到抑制

来自意大利的科学家们通过研究发现,逆转录转座子的表达或许在亨廷顿氏症中会受到一定的抑制。

2022-01-31

研究报道一株逆转座子异位插入导致耳聋的小鼠模型

  动物可以通过听觉来敏锐的感受周围其他个体和环境的声音。听觉的产生有赖于耳蜗的精巧结构和功能,以及耳蜗中阶的内淋巴液的稳态。中阶内淋巴液为耳蜗提供能量物质的维持和代谢物质的转运,而耳蜗中阶内淋巴液的稳态失调是导致耳聋的最主要的因素。耳蜗中阶的内淋巴液是由血管纹组织所分泌并维持其成分,例如150毫摩的钾离子浓度和80毫伏的蜗内电位,因此血

2021-10-24

Nat Immunol:“垃圾DNA”—逆转录转座子或是一把双刃剑!既能诱导肿瘤发生还能引发癌细胞死亡!

来自美国罗彻斯特大学等机构的科学家们通过研究揭示了诱发肿瘤的自私遗传元件引发癌细胞死亡的分子机制。

2021-10-28

研究揭示麦类特异转座子重塑小麦环境适应的调控网络

 转座子(Transposable Element,TE)是基因组中可移动的DNA元件。小麦族物种的转座子呈现爆发性增长,基因组高达3-16 Gb,85%以上由TE组成,而与之亲缘关系密切的二穗短柄草基因组只有272 Mb。可以说小麦的基因是“散落”在TE的海洋中,那么这些TE群体仅仅是自我复制垃圾序列,还是会影响宿主的基因活性与适应性呢?中国科学

2021-09-16

CRISPR大牛张锋教授发现一类极具应用潜力的新型基因编辑系统---转座子编码的RNA引导的DNA内切酶

研究人员发现了一类新的可编程的DNA修改系统,称为OMEGA,它们可能天然地参与了在整个细菌基因组中重排小片段 DNA的工作。

2021-09-12

Nature Communications:研究揭示动物中DNA转座子通过两种机制介导基因重复

转座子被认为是宿主基因组演化的重要推动力。其类型众多,包含non-LTR(Long Terminal Repeat)型逆转座子、LTR型逆转座子、Helitron型DNA转座子、TIR(Terminal Inverted Repeat)型DNA转座子等,可引起包含基因重复(gene duplication)在内的各种遗传突变。已有研究表明,non-LTR型逆

2021-07-14

研究人员挖掘高活性CRISPR转座酶用于正交多重编辑

  国际学术期刊Nucleic Acids Research在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心杨晟研究组的研究成果。该研究挖掘到一种高活性新型CRISPR相关转座酶(CASTs)。设计与调试微生物细胞工厂常需要中断一批基因和/或调试一批基因的最优剂量比。基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具受限于同源重组效率,难以同时编辑4

2021-09-11

Nature Genetics:逆转录转座子具有抑癌功能

   科学家们将跳跃基因称为转座子(transposable elements),其是一种短的DNA片段,在人类漫长的进化过程中能够随机插入到基因组中,跳跃基因的进化历史是目前很多研究人员的主要研究领域,但病毒感染被认为在其起源过程中扮演着关键角色。转座因子或转座子是遗传变异和基因组进化的主要参与者。长间隔元件-1(LINE-1

2021-04-11

研究揭示活跃转座子识别及表观沉默机制

   Nature Plants在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心、中科院-英国约翰英纳斯中心植物和微生物科学联合研究中心Jungnam Cho研究组题为Ribosome stalling and SGS3 phase separation prime the epigenetic silencing of trans

2021-03-08