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亚马逊参与新开发计算工具,助力COVID19研究

目前与冠状病毒感染相关的科学论文有1万多篇,最近几周来,防治COVID-19的研究正在加速,已经有4000多篇新的学术论文发表,涉及潜在的疫苗、疗法等多方面。要想快速推进这方面的研究,依靠人工处理这么大的信息量是低效的。对此,IRB巴塞罗那的结构生物信息学和网络生物学实验室在ICREA研究员Patrick Aloy的带领下,与亚马逊公司联合开发了一种计算工具

2020-04-05

PNAS:计算机技术帮助揭示癌症恶化的分子机制

近日,费城儿童医院(CHOP)领导的一项研究揭示了蛋白质可变剪切与促癌基因之间的联系。相关结果发表在《PNAS》杂志上。

2020-02-19

基于开关电路的DNA计算研究取得进展

 近日,中国科学院上海高等研究院光源科学中心物理生物学研究室、中国科学院上海应用物理研究所和上海交通大学合作开发了一种基于DNA链置换反应的开关电路来实现数字运算。与常用的逻辑门电路相比,开关电路结构精简,可以用最少的DNA序列实现高信噪比和快速计算的分子电路。他们展示了迄今为止最为快速的4位平方根运算。相关论文以Implementing digi

2020-01-17

Sci Rep:化学计算能够预测癌症的发生

最近,赖斯大学的科学家们开发出了一种鉴别癌前体细胞何时会变成成熟的癌症的方法。

2019-12-17

PNAS:计算生物学有助于开发统一的靶向基因疗法

近日,瑞典lund大学的神经科学家已经开发出一种新技术,可以对病毒的外壳进行改造,从而将基因疗法提供特定的细胞类型。

2019-12-18

EbioMedicine:科学家开发出新型计算模型 有望向癌症个体化疗法迈进一步

2019年12月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志EbioMedicine上的研究报告中,来自赫尔辛基大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型计算模型—结合重要性评分(CES,Combined Essentiality Scoring)模型,其能准确识别出癌细胞中必要的基因,从而帮助开发新型抗癌药物。图片来源:University

2019-12-09

Nat Methods:计算神经网络驱动下一代“蛋白质预测技术”的诞生

2019年10月23日 讯 /生物谷BIOON/ --一直以来,合成生物学家一直试图通过改变自然界中存在的蛋白质,甚至是从头合成蛋白质,将其进化的途径掌握在自己手中。通过人工构建不同类型的蛋白,可以设计药物,感测生物信号,以及生产高价值化学品,等等。为了设计蛋白质,科学家们使用了两种截然不同的方法。其一,在“定向进化”中,通过随机改变编码天然蛋白质的氨基酸残基的一级序列,并筛选具有所需活性的变体。

2019-10-23

华大智造 “超级生命计算机”DNBSEQ-T7 正式交付

2019年9月9日,由深圳华大智造科技有限公司(以下简称“华大智造”)自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7正式交付商用,首批测序仪已抵达华大基因科技服务有限公司和微基因(WeGene)等合作伙伴的实验室。来自交付前的用户测试数据表明,T7数据表现符合预期,各项指标均表现良好。作为“全球日生产能力最强”的基因测序仪,DNBSEQ-T7自发布就拥有多个“光环”:“首个4联芯片的测序平台”

2019-09-09

JCIM:计算提升蛋白质-蛋白质相互作用的预测精度

蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展,但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋,相互作用区域比较明确,而蛋白质-蛋白质相互作用则有可能发生在两个蛋白质表面上任何区域。因此,蛋白质-蛋白质相互作用的预测,需要对蛋白质

2019-10-10

计算和大数据重点专项项目成果“多模态自然人机交互神经系统疾病辅助诊断工具”入选国家卫健委“医疗健康人工智能应用落地30最佳案例”

  中国科学院软件研究所和中国医学科学院北京协和医院在国家重点研发计划“云计算和大数据”重点专项项目“云端融合的自然交互设备和工具”的支持下,将自然人机交互技术与神经系统疾病临床诊断方法结合,研制了“多模态自然人机交互神经系统疾病辅助诊断工具”,成功应用于神经系统疾病的早期预警与辅助诊断当中,在国家健康医疗相关领域发挥了重要作用,入选国家卫健委颁发的“医疗健康人工智能应用落地3

2019-08-07