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利用超级计算机发现125种可能对抗COVID-19的天然化合物

2020年6月22日讯 /生物谷 BIOON /——美国阿拉巴马大学亨茨维尔分校(UAH)的Baudry实验室从超级计算机快速评估的首批5万种天然化合物中鉴定出125种具有抗COVID-19病毒的潜力的化合物。这是首次使用超级计算机评估天然化合物对COVID-19产生的蛋白质的治疗效果。该实验室位于UAH的Shelby科技中心,目前正在使用惠普公司(HPE)

2020-06-22

科学家如何利用世界上最强大的计算机来帮助理解和阻断SARS-CoV-2的感染?

2020年6月18日 讯 /生物谷BIOON/ --在道格拉斯-亚当所著的《银河系漫游指南》中,傲慢的超级计算机“深思”为问及能否找到关于生命、宇宙和万物的终极问题的答案,他的回答是,能做到但非常棘手,当被问及多长时间时,他的回答是七百五十万年。现实生活中的超级计算机似乎也会被问到一些并不那么宽泛但却很棘手的问题,即如何应对COVID-19的大流行,其能被应

2020-06-18

科学家设计出更精确的公式计算狗狗年龄

在人生岁月里,你摇着尾巴的伙伴有多大了?根据著名的“狗年龄法则”,狗的1年相当于人的7年。7月2日发表在Cell Press细胞出版社旗下期刊《细胞系统》(Cell Systems)上的一项研究显示,这种说法是错误的。狗的年龄比我们想象的要大得多,而且研究人员根据生物衰老过程中DNA的化学变化,设计了一个更精确的公式计算狗的年龄。狗和主人生活在相同的环境中,

2020-07-14

研究人员利用计算推动微生物转氨元件发掘与氨基酸高效利用

 近年来,合成生物学的快速发展使微生物发酵生产天然氨基酸的成本持续降低,氨基酸产业取得了巨大发展。然而,我国作为氨基酸生产和消费大国,大宗型氨基酸产品已经进入供过于求的状态。因此,发展使用生物基L-氨基酸作为初始原料生产高附加值产品的新型生物技术,对可持续性发展与产业升级具有重要意义。酮酸作为L-氨基酸合成的直接前体物质,在人体和动物的新陈代谢中起

2020-07-16

PeerJ: 计算机模拟揭示癌症多样性

2020年5月1日讯/生物谷BIOON/---近日,由贝勒医学院的研究人员领导的在《the Lancet Oncology》杂志上发表的研究中,作者们开创了一种创新的局部化疗手段,从而为尿路上皮癌患者提供了保留肾脏的治疗选择。 “泌尿上皮癌是指泌尿系统衬里的癌症。虽然大约十种尿路上皮癌中有九种发生在膀胱(下尿道),但一小部分出现在上尿道,肾脏或输尿管衬里。

2020-04-30

WHO:科学家利用超级计算机模拟成功找到能有效抵御COVID-19的潜在活性物质

2020年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在World Health Organization网站上的研究报告中,来自美茵茨大学等机构的科学家们通过研究发现,被批准用于治疗丙肝的多种药物或能作为抵御COVID-19的潜在候选药物,COVID-19是由SARS-CoV-2冠状病毒感染所诱发的疾病。图片来源:NIAID这项研究中,研究人员模

2020-05-09

Science:让细胞化身为具有蛋白逻辑门的计算机

2020年4月7日讯/生物谷BIOON/---如今,允许计算机发挥功能的相同基础工具在分子水平上正被用于控制生命。这些进展对未来的药物和合成生物学有影响。在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学医学院的研究人员构建出作为分子逻辑门发挥作用的人工蛋白或者说定制蛋白。这些称为分子逻辑门的工具就像电子逻辑门那样,可用于对更复杂的系统的行为进行编程。他们指出这些新的人工

2020-04-07

COVID-19传播的计算机模型如何帮助我们对抗病毒

2020年3月11日讯 /生物谷BIOON /——利用数学和计算机模拟传染病传播过程的科学家正在研究这种新型冠状病毒,试图预测这种全球疫情可能如何演变,以及如何最好地应对。但有些人说,利用这些建模工具和研究人员的发现,还可以做更多的工作。"这是一种临时的、自愿的努力,我认为这是我们可以改进的地方,"约翰霍普金斯卫生安全中心的传染病建模师Caitlin Rive

2020-03-11

科学家开发出一款在线风险评估工具 其能帮助计算某个具体地点的COVID-19传播风险

2020年4月26日 讯 /生物谷BIOON/ --公共卫生专家和政府官员一直呼吁人们应该保持“社会距离”,他们要求人们呆在家里,尽量避免相互接触,这无疑会让很多家庭陷入困境,因为他们仍然要去社区购买食物,去药房或其它地方购买补给,人们也并不希望聚集扎堆,而且没有人知道哪些社区最有可能出现接触过病毒的人群。近日,来自凯斯西储大学等机构的科学家们通过研究开发了

2020-04-25

联合全世界闲置计算机来研究新冠病毒,斯坦福推出新项目

 全世界闲置的计算机联合起来!日前,由斯坦福大学潘德实验室(Pande Lab)主持的Folding@home分布式计算项目,正式向全世界发出邀请,寻找志愿者利用家里闲置的计算机,帮助研究人员开发新型冠状病毒的治疗方法。Folding@home(简称FAH)成立于2000年10月1日,是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算

2020-03-05