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Nature methods | 从序列到结构:探索CombFold组装算法的三重奏

CombFold能够有效地预测出大型蛋白质复合体的三维结构,即使是对于那些由多个不同亚基构成、结构复杂度高的复合体也同样适用。

2024-02-13

Science:利用PACE平台构建出更小的蛋白降解标签,用于精确触发细胞天然蛋白的降解

在这项新的研究中,这些作者利用Liu 于2011年在哈佛大学开发的PACE平台,生成了一种可能与PT-179配合使用的ZF degrron。PACE允许人们快速进化出具有有用特征的新蛋白。

2024-03-25

研究发现MAGI家族蛋白的PDZ-GK超结构域是一种新型磷酸化蛋白识别模块

蛋白质的磷酸化/去磷酸化及其介导的蛋白复合物的组装/解离是细胞内信号转导的关键调控方式之一。磷酸化依赖的蛋白-蛋白相互作用通常是由磷酸化蛋白结合结构域介导。这些结构域包括14-3-3、FHA、MH2、

2023-05-18

研究揭示三维基因组拓扑相关结构域边界的CTCF组织规律

该研究首次解析了三维基因组TAD边界处朝向TAD外CTCF位点的重要生物学功能,揭示了TAD边界CTCF位点的组织架构规律,为阐明TAD边界处成簇CTCF位点的绝缘功能提供了新的思路。

2023-12-17

Nature Cell Biology:跨区机械力协调细胞形状和命运转变,生成组织结构

研究团队以小鼠毛囊胎盘为范例,构建并从遗传学角度验证了上皮片转化为胎盘芽的生物力学模型

2024-02-26

Nat Commun:新研究鉴定出蛋白酶体降解受损的蛋白时产生的免疫肽

研究人员利用实验室实验展示了蛋白酶体如何降解完整的蛋白,并对产生的肽进行了定性和定量测定。

2024-02-24

预测几乎所有分子结构,带来药物研发新范式

虽然新的AlphaFold预示着一个充满前所未有可能性的时代,但必须承认它的局限性。

2023-11-03

研究揭示叶绿体蛋白转运马达新功能

上述研究为探讨高等植物叶绿体基因表达、细胞器R-loop调控以及光合膜蛋白复合体组装等科学问题提供了新见解。

2024-01-02

Nature chemistry:几何挫折相互作用驱动无定形碳酸钙的结构复杂性

近段时间,来自牛津大学化学系无机化学实验室的Tomas C. Nicholas教授及团队报告了利用最先进的原子间位势生成的高质量无定形碳酸钙原子模型,以帮助指导拟合 X 射线全散射数据。

2024-01-29

Science: 开发出基于强化学习的蛋白结构设计方法

在一项新的研究中,来自美国华盛顿大学的研究人员成功地将强化学习(reinforcement learning)应用于分子生物学的挑战。他们开发出一种强大的新蛋白设计软件,该软件改编自一种在国际象棋和围

2023-04-30