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研究人员预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标识别机制

中国科大刘海燕教授、陈泉教授课题组与复旦大学王文宁教授合作,采用蛋白质结构预测、序列设计等计算手段与蛋白质互补分析和深度突变扫描、X射线晶体学、NMR等实验结合的方法,揭示了固有无序的4.1G蛋白C端

2023-10-07

Cell:揭示卵子受精后,ZP2蛋白切割通过调节卵外被的结构来阻止更多精子进入

研究人员结合 X 射线晶体学和低温电镜研究了卵外被蛋白的三维结构。他们在小鼠体内对精子与携带 ZP2 蛋白突变的卵子之间的相互作用进行了功能性研究

2024-04-01

Science:中外科学家携手首次发现油菜素甾醇输出蛋白并破解它的三维结构

这项新的研究阐明了拟南芥ABCB19作为BR输出蛋白的作用,为ABC家族的研究开辟了新思路。

2024-03-26

Science:解析出两种帕金森病相关蛋白结合在一起时的三维结构

蛋白LRRK2和Rab29是两种与晚发性帕金森病有关的蛋白。LRRK2是一种蛋白激酶,它能在一种叫做磷酸化的过程中修饰其它蛋白。Rab29是Rab GTP酶家族的成员,它能调节细胞转运,并能调节LRR

2024-01-12

Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白

2023-09-27

Cell:大脑中的PNMA2蛋白形成的病毒样结构可能有助于解释一些癌症引起的记忆丧失

在一项新的研究中,来自美国犹他大学的研究人员发现,一些肿瘤会释放一种看起来像病毒的蛋白,从而启动一种失控的免疫反应,从而可能会损害脑细胞。

2024-02-25

Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法

具体而言,对于输入的蛋白质结构,首要任务是确定其表面上anchor的位置。这些anchor位置是通过对蛋白质表面潜在结合配体的空间区域进行采样、过滤、聚类等操作后得到的。

2023-08-21

Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

Nat Commun:科学家揭示免疫逃逸HIV蛋白复合体的特殊结构

来自冲绳科学技术大学院大学等机构的科学家们通过研究利用冷冻电子显微镜技术揭示了APOBEC3G-Vif复合体的原子结构。

2023-07-28