JMC | 开展卤键对蛋白质结构稳定性及其与多肽结合影响的计算研究
对于蛋白-多肽间的卤键,研究人员通过QM/MM结构优化、自然键轨道(NBO)理论和独立梯度模型(IGM)分析,证实蛋白-卤代多肽复合物间形成了强卤键。
2024-04-22
Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法
具体而言,对于输入的蛋白质结构,首要任务是确定其表面上anchor的位置。这些anchor位置是通过对蛋白质表面潜在结合配体的空间区域进行采样、过滤、聚类等操作后得到的。
2023-08-21
Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高
与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任
2023-10-17
单结构域蛋白质索烃的设计和合成方面取得重要进展
以对蛋白质进行环化、索烃化、打结等拓扑改造为代表的蛋白质拓扑工程是一种重要的调控蛋白质性质的手段。近年来,基于可基因编码的蛋白质缠结基元和反应基元的“组装-反应协同”理念,发展
2023-07-26
研究人员发布蛋白质-纳米材料界面相互作用的结构质谱表征实验手册
近日,中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子结构表征新方法研究组研究员王方军团队发布了表征蛋白质-纳米材料界面相互作用精细结构的赖氨酸反应性分析-质谱(LRP-MS)实验手册。
2023-08-16
蛋白质设计迎来“智能生成时代”
2023年以来,智能大模型成为一个热词,也成为赋能各个行业的一个重要工具。而生物科学作为可高度数字化的系统,具备可解读、可编程的特性,成为智能大模型赋能的一个重要领域。
2023-12-18
大脑结构异常可致发育性口吃
墨尔本大学研究人员领导的一项新研究发现,一种新的基因通路与成年口吃者的大脑结构异常之间存在联系,这为增强对持续性发育性口吃的理解开辟了全新的研究途径。
2023-11-24
Cell:通过空间蛋白质组学发现新的突触类型
慕尼黑大学生命分子物理学主席说,“我们深信,SUM-PAINT 不仅是在分子水平上破译复杂的细胞生物学过程中的一个里程碑,也是在发现神经退行性疾病的新治疗方法方面的一个潜在突破。”
2024-04-21