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MIT团队提出蛋白生成新模型,无需预训练,可从头生成新蛋白质,主链长度可达500个氨基酸序列

近日,麻省理工学院的研究人员开发出了一种扩散模型 FrameDiff,这是一种生成式深度学习工具,能够生成自然界中不存在的新型蛋白质结构。在研究中,研究团队将 FrameDiff 应用于蛋白质主链生成

2023-07-24

微纳米塑料对小鼠/大鼠动物模型的毒性作用 ——系统综述和mate分析

微/纳米塑料 (Micro/nano plstics, MNPs) 被认为是一类新兴的环境污染物,主要来自排放到环境中的塑料废品分解以及直接从塑料产品释放产生,在尺度上小于5 mm,有的甚至成为纳米级

2023-05-25

先导编辑技术,轻松设计癌症突变小鼠模型,加速癌症基因突变研究

研究团队在小鼠中构建了Cre重组酶诱导的体内先导编辑系统,利用该系统,可以通过脂质纳米颗粒在体内进行体细胞先导编辑,还能通过病毒载体递送先导编辑的pegRNA,或原位移植先导编辑过的类器官

2023-05-16

Cell重磅:通过计算模型预测先导编辑效率及脱靶率,拓展其应用前景

这项发表在 Cell 的研究大规模分析了先导编辑效率数据,由此广泛表征了先导编辑的决定因素,并开发了一系列的计算模型来预测在多种细胞类型中不同先导编辑系统的效率,以及脱靶率。

2023-05-10

Cell:成功构建出可以研究人类小胶质细胞的发育和功能的类器官模型

来自美国索尔克生物科学研究所的研究人员在一项新的研究中开发出一种类器官(organoid)模型,即一种模拟人体组织特征的三维细胞集合。该模型使得他们能够首次在人类来源的活组织中研究人类小胶质细胞的发育

2023-05-17

Nat Commun:科学家开发出能揭示大脑如何获取必要Ω-3脂肪酸的特殊模型

来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型斑马鱼模型,其能提供新的信息来揭示大脑如何获得必要的Ω-3脂肪酸的,包括二十二碳六烯酸(DHA)和亚麻酸(ALA)。

2023-05-22

西湖大学马丽佳团队开发全新深度学习模型,精准预测SpCas9/gRNA活性及特异性

在多个GUIDE-seq测试数据集上相对于应用较广的CFD模型,AIdit_OFF无论特异性还是召回率表现的都更好,且将预测gRNA脱靶位点的精准率平均提高了2.6倍。

2023-05-25

上海复旦大学舒易来团队开发了一种遗传性耳聋理想的小鼠模型

先天性听力损失是儿童中最常见的感觉障碍之一,超过一半的病例是由基因突变引起的。超过100个基因与综合征和非综合征性听力损失有关,包括常染色体显性基因座、常染色体隐性基因座、x连锁基因座和线粒体基因座。

2023-05-23

清华大学构建和鉴定非人灵长类类胚胎模型

胚胎着床至原肠运动是发育的关键时期,也是临床早期流产的高发期。受限于伦理争议和样本来源,相比于模式动物,灵长类围着床后发育的相关研究明显滞后。

2023-04-21

通过AI模型预测mRNA降解,提高mRNA疫苗稳定性

研究团队使用深度学习(Deep Learning)技术创建了一个有效且可解释的模型架构——RNAdegformer,该技术可以比以前的最佳方法(如Degscore模型、RNA折叠算法和其他机器学习模型

2023-04-13