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  • 北京基因组所开发系列特色科学数据库

    近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数

  • 研究人员开发长非编码RNA数据库LncBook

    近日,由中国科学院北京基因组研究所开发的人类长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)数据库LncBook正式上线。该项研究成果以LncBook: a curated knowledgebase of human long non-coding RNAs 为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。近年来,有关lncRNA的

  • Nature:发现最大白血病数据库 辅助治疗药物的最优选

     历经多年研究,科学家们发布了一个庞大的数据集,详细描述了500多名患有急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia,AML)患者肿瘤细胞的分子组成。该数据集包括数百个个体患者的细胞如何在实验室中对一系列药物做出反应,为日后对于AML的研究进一步打下基础。10月17日,《Nature》杂志以“Functional genomic landscape of acute

  • Nature:推出小鼠细胞的开源数据库---Tabula Muris

    2018年10月5日/生物谷BIOON/---来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub),弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队组建了一个名为Tabula Muris的小鼠细胞信息的开源数据库(网址:https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/)。在他们发表在Nature期刊上的标题为“Single

  • 升级版环形RNA数据库网站发布

      近日,国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中科院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2: An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati

  • Nature子刊报道大型衰老相关基因表达谱数据库建成

     英国《自然·通讯》杂志30日发表的一项研究称,包括人类在内的4个物种的大型衰老相关基因表达谱数据库建成。德国科学家团队分析数据后发现,衰老相关基因的表达变化与退行性慢性病相关基因的表达变化轨迹一致,但与癌症的相反。对衰老及衰老相关疾病的研究,一直是人类医学的难题。但随着“衰老基因”的确定,衰老过程中疾病发生的潜在分子机制正在逐渐揭露,为人们预测衰老相关疾病提供了新的遗传基础。在此次研究

  • DNA数据库向犀牛偷猎者开火

    研究人员表示,一个拥有数千头非洲犀牛脱氧核糖核酸(DNA)的基因数据库已经能够确保给偷猎者定罪,并且自从8年前成立以来,其带来了更为严厉的刑事判决。然而,并不是所有的科学家都确信这项努力是值得的。在1月8日发表于《当代生物学》杂志的一篇论文中,研究人员强调了这个数据库,它已被应用于超过120个案例中。在一个案例中,2017年,犀牛偷猎者Simon Ngomane被判处28年监禁。他于2011年在南

  • Nucl Acids Res:重磅!科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库

    2018年1月5日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本,开发出了集合血液代谢物的数据库,目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。图片来源:www.thoughtco.com代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程,同时还能阐明细胞和其周围环境之间的相互

  • 中国科学家构建首个创伤后应激障碍遗传学数据库

     创伤后应激障碍(Posttraumatic stress disorder,PTSD)发生在创伤事件暴露后,是具有复杂病因的综合征。美国2013年公布的第五版《精神障碍诊断与统计手册》中,PTSD已从“焦虑障碍”组移到新的分组“创伤和应激相关障碍”中。经历创伤事件是罹患PTSD的必要条件之一,关于全球创伤事件暴露的流行病学研究表明,70%的受访者至少报告了一例创伤事件,但其中只有少数人

  • 中国科学家发布表观基因组数据库MethBank 3.0

    中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Research上。Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。作为表观修饰的重要组成部分,DNA甲基化