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  • 模式硅藻的蛋白质组精细图谱完成

       硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物,分布广泛,提供了地球上约20%的初级生产力,对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物,其基因组序列于2008年公布,但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)是利用蛋白质组学数据,尤其是高精度的串联质谱数据,结合基因组和转录组

  • Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

      近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27,341对lncRNA-药物可预关联(lncRNA-drug predictiv

  • Cell:重大进展!首次构建出哺乳动物单细胞染色质可接近性图谱

    2018年8月26日/生物谷BIOON/---科学家们对DNA缠绕和包装到所谓的染色质中的方式感兴趣,这是因为这会影响每个细胞中可用到的遗传信息。DNA就像串在一根绳子上的念珠。在这些分子“念珠”移动的地方会有空间形成,这样蛋白就能够访问和“读取”遗传信息。这种状态或者说这种基因组特征就是染色质可接近性(chromatin accessibility, 也译作染色质开放性)。在一项新的研究中,来自

  • Cell:科学家有望成功绘制出人类大脑神经系统详细图谱 或能阐明多种神经性疾病的发生根源

    2018年8月21日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Cell上研究报告中,来自瑞典卡罗琳学院的研究人员通过研究绘制出了小鼠神经系统中多种细胞类型的系统且全面详细的图谱,该图谱或能为研究人员提供揭示机体神经性疾病起源的线索,此外,研究人员还能利用相同的方法来绘制出关于人类大脑的详细图谱。图片来源:CC0 Public Domain大脑神经系统中含有上千种不同类型的神经元细胞、

  • Cell:利用CRISPRi技术绘制人细胞中的基因相互作用图谱

    2018年7月22日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山分校的研究人员使用一种基于CRISPR的高通量技术快速地绘制人细胞中将近500个基因的功能图谱,其中的许多基因之前从未被详细地研究过。相关研究结果于2018年7月19日在线发表在Cell期刊上,论文标题为“Mapping the Genetic Landscape of Human Cells”。这项研究产生了大

  • 首个肺癌全息细胞图谱问世

    肺癌是发病率和死亡率增长最快,对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一,治愈起来较为困难,而且近年来肺癌患者有年轻化的趋势。虽然目前科学家在肺癌治疗方面取得了巨大的进展,但对其细胞层面上的科学认识仍难尽如人意。近日,著名学术期刊《Nature Medicine》重磅推出了史上最完整的肺癌细胞图谱!这将是科学家们在细胞层面深入了解肺癌真相的最佳契机!来自鲁汶大学等机构的研究人员通过对数以千计的健康与癌

  • Nat Med:重磅!科学家首次绘制出肺部肿瘤的完整细胞图谱

    2018年7月13日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Medicine上的研究报告中,来自鲁汶大学等机构的科学家们通过研对数千个健康和癌变的肺部细胞进行研究,首次开发出了肺部肿瘤细胞的全面图谱,研究人员对52种不同的细胞类型进行了区分,研究结果表明,肺部肿瘤或许远比我们认为的要复杂的多,同时研究人员还希望基于本文研究结果来开发出有效治疗多种肺癌的新型疗法。图片来

  • Nat Commun:科学家成功绘制出与人类黑色素瘤发生相关DNA损伤图谱

    2018年7月10日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自华盛顿州立大学和乔治亚州立大学的科学家们通过联合研究绘制出了黑色素瘤复发性突变的关键环节图谱,黑色素瘤是一种人类最严重的皮肤癌。图片来源:Wikipedia/CC BY-SA 3.0这项研究中,研究者发现,通过名为ETS的特定转录因子进行的DNA结合作用或许会在

  • 单细胞水平肺癌T细胞免疫图谱绘就

      日前,《自然—医学》在线发表中国科学家的一项成果,研究通过国际领先的单细胞转录组测序技术和生物信息学分析方法,完整刻画了与非小细胞肺癌相关的T淋巴细胞图谱,揭示了肺癌T细胞的亚群分类、组织分布特征、肿瘤内群体异质性及药物靶基因表达情况,鉴定了跨组织分布的T细胞类群及亚群间潜在的状态转换关系,为肺腺癌提供了新的临床标志物。据悉,该研究由北京大学生命科学学院BIOPIC中心、北

  • Genome Med:科学家利用计算机算法成功绘制出了癌细胞对疗法耐药性的图谱

    2018年7月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自约翰霍普金斯大学的研究人员通过研究开发了一种新方法来分析头颈癌对疗法耐受性的进化改变特性。研究人员想知道随着时间延续癌症如何对疗法产生一定的耐受性,以及能利用计算机建模的手段来分析这些改变从而确定患者机体癌细胞产生耐受性的特定时间轴。图片来源:Johns Hopkins Ki