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Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

清华大学开发冷冻电镜密度图分辨率估计的人工智能算法

清华大学生命科学学院/结构生物学高精尖创新中心/清华-北大生命科学联合中心张强锋副教授课题组在《分子生物学》(Journal of Molecular Biology)杂志在线发表题为“CryoRes

2023-05-04

Cell:解析出蛋白LRP2的三维低温电镜结构

在一项新的研究中,来自美国哥伦比亚大学等研究机构的研究人员首次揭示了一种生死攸关的蛋白---LRP2---的三维结构,其清晰度足以最终揭示它是如何起作用的。

2023-02-21

研究报道红藻藻胆体-光系统II复合体的原位冷冻断层三维结构

  海洋藻类为适应海底微弱的光环境进化出不同于高等植物的捕光系统。藻胆体(phycobilisome, PBS)则是蓝藻和红藻位于类囊体膜上的色素-蛋白超分子捕光复合体, 具有高效捕获传递光能的作用。藻胆体捕获的光能进一步传递给镶嵌于类囊体膜内的光系统II(photosystem II, PSII),在这个重要场所进行电荷分离,利用光能分

2021-09-26

Science封面重磅:新型AI算法准确预测RNA三维结构

  近日,美国斯坦福大学在读博士生 Stephan Eismann 和 Raphael Townshend 在计算机副教授 Ron Dror 的指导下,利用目前先进的神经网络技术,成功开发出了一种全新 RNA 三维结构预测模型——ARES。与其他传统 AI 算法不同,ARES 的结构框架并不是针对 RNA 结构设计,而是针对原子结构设计的

2021-09-01

《Nature Methods》:研究提出一种新型的冷冻电镜三维重构算法

近期,清华大学生命科学学院李雪明研究组,电子工程系沈渊研究组和计算机系杨广文研究组三方合作在《自然 方法》(Nature Methods)杂志在线发表题为《一种基于粒子滤波的鲁棒的冷冻电镜三维重构算法框架》(A particle-filter framework for robust cryoEM 3D reconstruction)的研究论文。该工作通过将电子工程应用中的粒子滤波算法引入到冷冻电

2019-01-20

Nat Commun:新技术帮助实现大脑三维重构

2018年3月16日 讯 /生物谷BIOON/ --最近,研究者们在大脑成像领域取得了新的突破,他们成功地揭示了大脑的精细结构。这项技术帮助他们重构了大脑组织样本的3D图像,从而能够在显微水平建立大脑的3D高清图像。通过来自伦敦皇家学院与香港大学的研究者们的合作,他们相信该技术能够帮助揭示许多严重的神经疾病的发病机制。(图片来源:Imperial College London)传统来说,大脑样品的

2018-03-16

《自然》发文报道首个完整藻胆体的冷冻电镜三维结构

2017年10月19日,清华大学生命科学学院隋森芳教授研究组在《自然》(Nature)杂志上以长文(Research Article)形式在线发表题为《海洋红藻藻胆体的结构》(Structure of phycobilisome from the red alga Griffithsia pacifica)的研究论文,首次报道了世界上第一个完整藻胆体的近原子分辨率的冷冻电镜三维结构,为揭示藻胆体的

2017-10-22

Molecular Cell:中国科学家揭示A型流感病毒RNA聚合酶复合体的三维冷冻电镜结构

中国科学家揭示A型流感病毒RNA聚合酶复合体的三维冷冻电镜结构

2015-01-24

PLOS COMPUT BIOL:无三维晶体结构的靶标药物发现的新算法

药物-靶标相互作用是靶标识别和药物分子设计的基础。通常认为理想的药物作用模式是,一个药物作用于一个靶标,用于治疗一种疾病;但近年来,随着系统生物学(Systems Biology)的出现和快速发展,网络药理学(Network Pharmacology)思想已被广泛接受。

2012-11-18