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Nature子刊:腾讯AI Lab发布scBERT模型,攻克单细胞测序数据分析痛点

该研究创新性地提出关于单细胞注释的 scBERT 算法模型,实现了高解释性、高泛化性、高稳定性的单细胞类型注释技术。这项研究成果对于单细胞转录组测序数据分析领域未来研究具有深远意义。

2022-09-28

Science:在迄今最大规模的基因测序数据中鉴定替换突变特征

突变特征(mutational signature,也译为突变信号、突变标记或突变签名)---在肿瘤发生过程中起作用的DNA损伤和修复过程的印记---使人们了解每名患者所患癌症的环境原因和内源性原因。

2022-04-23

针对大规模基因测序数据寻找与常见疾病有关的罕见遗传变异的检验方法

 2020年8月24日, 《自然-遗传学》(Nature Genetics) 在线发表了哈佛大学林希虹教授团队的最新研究成果。研究团队提出了一个针对大规模全基因组测序数据的罕见变异检验方法STAAR(variant-Set Test for Association using Annotation infoRmation)。该方法有效地引入并整合了

2020-09-03

研究开发单细胞空间转录数据分析可视化平台

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相

2019-11-16

Enpicom完成120万欧元融资 致力于开发测序数据分析平台

  近日,生物医学软件开发公司Enpicom宣布完成A轮120万欧元融资。本轮融资由BOM Brabant Ventures领投,Nextgen Ventures和Arches Capital跟投,所融资金将用于ImmunoGenomix(IGX)平台的开发,以及市场推广。Enpicom成立于2015年,总部位于荷兰北布拉班特,是一家创新生物医学软件开发公司。该公司专注于为免疫

2019-03-15

转录测序数据分析及案例实践班(第四期)

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-

2018-03-12

科学家成功利用基因测序数据对人群进行鉴别

2017年9月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中,来自国外的研究人员通过研究,利用全基因组测序和机器学习等技术成功实现了对每个人面部及其它机体特征进行鉴别。图片来源:Human Longevity, Inc.研究人员认为,这项研究或为法医提供了新的方法来识别凶手,同

2017-09-08

转录测序数据分析及案例实践班(第二期)

转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(Non-coding RNA)。现在主流的非编码RNA又包括:circRMA,microRNAs,及lncRNAs。转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和 空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-

2017-05-26

转录测序数据分析及案例实践

2017年,生物谷将与国家基因检测技术应用示范中心共同举办本次全转录组测序数据分析及案例实践班。本次培训从生物信息基础语言入门培训,到各类RNA测序分析介绍,再到lncRNA的鉴定与功能推断,最后到R语言基础与作图。整个理论和实操的培训课程下来,相信您对全转录组的生物信息学应用和分析会有一个全面的理解和运用,这也是本次培训班的办学目的。

2017-03-09

转录测序数据分析及案例实践

2017年,生物谷将与国家基因检测技术应用示范中心共同举办全转录组测序数据分析及案例实践班,同时,生物芯片上海国家工程研究中心和上海生物信息技术研究中心也将作为协办方共同完成此次培训。

2017-03-09