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Cell:揭开人类肠道中数量最多遗传元件——隐秘质粒pBI143

研究团队通过霰弹枪宏基因组学和全新质粒预测算法对来自人类肠道的68000多个质粒进行了表征,并在不同地理、不同种族的人群中发现了一种最普遍存在的隐性质粒——pBI143。

2024-03-31

Nature:董欣年/项耶子揭示动态调控翻译起始的新元件

该团队结合了高分辨率的翻译组学和结构组学技术,首次揭示了植物免疫过程中,mRNA的结构变化动态调节了翻译起始密码子的选择,由此促进抗病相关的mRNA翻译效率提高,增强了植物的抗病性。

2023-09-08

确定了DNA中的一类新的调控元件---促进子

在一项新的研究中,来自英国牛津大学和美国纽约大学的研究人员在DNA中的密码如何被读取方面取得新的进展。他们提出“促进子(facilitator)”,即一种新发现的非编码DNA,

2023-12-20

复旦大学赵兴明/杨禹丞团队构建人脑非编码调控元件互作网络图,精细定位脑疾病基因

综上所述,该研究构建了人脑中的非编码调控元件互作网络的概览图,分析了其在神经细胞和组织中的特异性,并据此对脑疾病基因进行了系统而精准的定位,为理解脑疾病和行为认知表型的遗传调控机制提供了新见解。

2023-07-28

Science:揭示人类顺式调控元件和转录因子结合位点在哺乳动物中的进化景观

包括人类在内的哺乳动物实现了高度的机体复杂性,这主要是由于它们的蛋白是如何被调控的;表征人类基因组的调控景观是现代生物学的一个长期目标。当前的方法测量全基因组的生化信号,包括染色质可及性、组蛋白修饰、

2023-05-08

刘陈立/傅雄飞开发空间连续定向进化系统,实现合成生物元件的大规模平行进化

着眼于合成生物学研究中可用元件匮乏这一亟待解决的关键问题,在现有连续定向进化方法的基础上,通过实验与模型模拟相结合的方式定量研究了宿主细菌的空间迁移运动对其噬菌体进化的作用规律

2022-09-23

Nature Communications:发现环形RNA中存在驱动翻译的短序列元件

该研究通过对随机序列的筛选,系统性鉴定出多个类IRES(内部核糖体进入位点)元件来驱动环形RNA的翻译,并进一步通过分析质谱数据,鉴定出近千个能翻译的内源性环形RNA

2022-07-06

Nucleic Acids Research:报道非编码调控元件能够稳定染色质三维结构

发现了一系列位点与细胞生长和存活密切相关。该研究首次发现该类增强子位点的删除能够改变大范围染色质结构,通过同时影响多个非必需基因表达所产生的协同效应来影响细胞稳态。

2022-04-26

Cell:合成基因元件的跨物种表达有助发现人类微生物组衍生性的代谢物

超过60%的药物,包括抗生素和癌症治疗药物,都来自于由代谢基因编码的小分子形式的天然产物。这些分子通常形成复杂的化学结构,而且是在包括细菌、植物和人类在内的多种生命形式中经过数十亿年的进化而形成的。然

2022-04-09

Nature Genetics:科学家揭示人类基因调控元件的序列决定因素

  DNA可以决定基因表达的位置和时间,但控制基因表达的全套序列决定因素仍不清楚。近日,芬兰赫尔辛基大学的研究团队在《Nature Genetics》发表了题为“Sequence determinants of human gene regulatory elements”的文章。研究人员使用大规模平行报告试验测量了比人类基因组大100倍

2022-03-17