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三维粒子追踪领域取得进展

  在生命科学、药物研发等领域,纳米粒子定位及追踪技术具有广泛需求。外泌囊泡、病毒和纳米药物载体是生物体内常见的纳米粒子,它们的动态转运是实现胞间通讯、侵袭感染、药物递送等功能的重要过程。因此,实时捕捉这些粒子的胞内外运动在探寻生命活动基本规律及药物转化研究中具有重要意义,这对于阐明疾病发病、病毒动态侵染宿主细胞机制等关键科学问题,以及推

2021-10-20

研究报道红藻藻胆体-光系统II复合体的原位冷冻断层三维结构

  海洋藻类为适应海底微弱的光环境进化出不同于高等植物的捕光系统。藻胆体(phycobilisome, PBS)则是蓝藻和红藻位于类囊体膜上的色素-蛋白超分子捕光复合体, 具有高效捕获传递光能的作用。藻胆体捕获的光能进一步传递给镶嵌于类囊体膜内的光系统II(photosystem II, PSII),在这个重要场所进行电荷分离,利用光能分

2021-09-26

Science封面重磅:新型AI算法准确预测RNA三维结构

  近日,美国斯坦福大学在读博士生 Stephan Eismann 和 Raphael Townshend 在计算机副教授 Ron Dror 的指导下,利用目前先进的神经网络技术,成功开发出了一种全新 RNA 三维结构预测模型——ARES。与其他传统 AI 算法不同,ARES 的结构框架并不是针对 RNA 结构设计,而是针对原子结构设计的

2021-09-01

Science:利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构

美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下,利用巧妙的新型机器学习技术,开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是,即使只从少数已知结构中学习,他们的方法仍然成功,这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。

2021-08-28

Genes & Development:发表增强子eRNA调控三维基因组重要研究进展

增强子是人类基因组中一大类非常重要的顺式调控元件,能够参与染色质的空间折叠和基因的表达调控。在人类基因组中存在着成千上万的增强子,它们在组织器官发育过程的基因调控中起到重要作用。上世纪90年代,研究者发现增强子能够转录出RNA。直至2010年,增强子转录出的RNA才被命名为eRNA。在eRNA刚被发现的时候,它们被当成不具有生物学功能的转录“副产物”。随着研

2021-09-18

中山医学院丁俊军教授团队系统绘制相分离溶解与重建过程的染色质三维结构图谱

细胞内广泛存在相分离(Phase Separation)现象,成千上万的蛋白或核酸分子在复杂的细胞内部形成一个一个无膜“隔间”,就像油滴在水中一样,彼此互不干扰地参与细胞内如转录调控、应激、蛋白质质量控制、DNA复制等多种重要的生物学过程。1,6-己二醇(1,6-HD)是一种能够使得相分离液滴溶解的化学小分子,它是目前唯一的能同时破坏多种相的工具,所以非常有

2021-09-03

研究发现人源甲状旁腺激素受体2复合物三维结构

中国科学院上海药物研究所王明伟/杨德华团队、徐华强/赵丽华团队携手蒋华良/程曦团队,在PNAS上在线发表了研究成果Molecular insights into differentiated ligand recognition of the human parathyroid hormone receptor 2。这篇由诺贝尔化学奖得主Robert J.

2021-08-10

eLife:解析人源葡萄糖依赖性促胰岛素释放多肽受体三维结构

   葡萄糖依赖性促胰岛素释放多肽受体(Glucose-dependent insulinotropic polypeptide receptor, GIPR)属于B1类G蛋白偶联受体,在脂肪生成、胰岛β细胞增殖和胰岛素释放等方面发挥重要作用,与2型糖尿病、肥胖症和神经退行性疾病相关。该受体的内源性配体为葡萄糖依赖性促胰岛素释放

2021-08-04

Nature:利用人工智能系统Alphafold发布最完整的预测人类蛋白质三维结构数据库

2021年7月24日讯/生物谷BIOON/---2021年7月22日,DeepMind宣布与欧洲分子生物学实验室(EMBL)合作,为人类蛋白质组的预测蛋白质结构模型建立迄今为止最完整、最精确的数据库。这将涵盖人类基因组所表达的全部约20000种蛋白质,并且这些数据将免费向科学界公开提供。该数据库和人工智能系统为结构生物学家提供了探究蛋白质三维结构的强大的新工

2021-07-24