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Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法

该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录

2023-06-21

我国科学家领衔发表8篇Science论文+2篇Science子刊以及1篇Nature子刊,通过灵长类基因组计划揭示灵长类动物进化的秘密

在中国浙江大学生命演化研究中心的张国捷(Guojie Zhang)教授、中科院昆明动物研究所的吴东东(Dong-Dong Wu)研究员、西北大学的齐晓光(Xiao-Guang Qi)教授、云南大学的于

2023-06-29

Nature及其子刊首次利用特殊设计的胶囊CapScan收集人体消化和微生物的信息

通过使用一种特殊设计的胶囊CapScan,来自加州大学戴维斯分校、斯坦福大学和Envivo生物公司等机构的研究人员如今可以让它在消化系统中航行,收集有关消化和微生物的新数据。相关研究结果于2023年5

2023-05-29

Nat Rev Cardiol:科学家揭示暴露组的概念 并阐明不健康的环境诱发人类心血管疾病背后的分子机制

来自德国美茵茨约翰内斯-古腾堡大学等机构的科学家们描述了如何利用暴露组(exposome)改变来描述环境压力因素对机体心血管系统健康所产生的影响。

2023-05-26

单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17

Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3

总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。

2023-05-15

Science:揭示数百种胎盘哺乳动物的进化限制和创新

基因组学面临的一个主要挑战是辨别数十亿个碱基中哪些碱基改变了有机体的表型并影响了健康和疾病风险。过去对碱基的选择性压力的证据,无论是高度保守的还是快速进化的,都是功能重要性的标志。在所有哺乳动物中没有

2023-05-09

Science:揭示人类加速进化区发生的结构变异导致人类基因组折叠方式不同于其他灵长类动物

一百多万年前,人类基因组的大部分发生重组---这是卵子或精子形成过程中的偶然事件,可导致了DNA片段的缺失、重复或逆转。如今,在一项新的研究中,来自美国格拉斯通研究所的研究人员发现,这些结构变异(st

2023-05-08

Science:揭示人类顺式调控元件和转录因子结合位点在哺乳动物中的进化景观

包括人类在内的哺乳动物实现了高度的机体复杂性,这主要是由于它们的蛋白是如何被调控的;表征人类基因组的调控景观是现代生物学的一个长期目标。当前的方法测量全基因组的生化信号,包括染色质可及性、组蛋白修饰、

2023-05-08

Science:利用机器学习将哺乳动物的增强子变异与复杂表型关联在一起

不同的表型,包括相对于身体大小的较大大脑、群体生活和发声学习能力,在整个哺乳动物历史上已经进化了多次。这些共同的表型可能通过基因组比较识别出的共同机制而反复出现。

2023-05-08