Molecular Cancer:中国领衔的大规模食管癌研究,发现无创早筛新血清标志物
来源:奇点糕 2022-03-20 21:18
食管癌是严重危害人类健康的公共卫生难题。全球范围内,因癌去世的患者,每二十位中就有一位是死于食管癌!食管鳞癌占全世界食管癌病例的80%以上,在东亚和非洲地区尤其高发。其中,在中国,食管鳞癌是发病率第六,死亡率第四的恶性肿瘤。食管鳞癌的预后很大程度上取决于确诊时的临床分期,早期食管鳞癌经微创治疗,五年生存率可达90%以上;而中晚期食管鳞癌经手术、放疗和化疗后,
食管癌是严重危害人类健康的公共卫生难题。全球范围内,因癌去世的患者,每二十位中就有一位是死于食管癌!
食管鳞癌占全世界食管癌病例的80%以上,在东亚和非洲地区尤其高发。其中,在中国,食管鳞癌是发病率第六,死亡率第四的恶性肿瘤。
食管鳞癌的预后很大程度上取决于确诊时的临床分期,早期食管鳞癌经微创治疗,五年生存率可达90%以上;而中晚期食管鳞癌经手术、放疗和化疗后,五年生存率目前仍不足30%。因此,食管鳞癌的早期检测在食管癌的防治中极其关键,能为及时干预和有效治疗提供宝贵的时间窗口,显着提升患者预后。
当前,食管鳞癌的早筛有鳞状细胞癌相关抗原(SCC-Ag)等几种血清标志物,但敏感性和特异性差强人意,都尚不足以作为独立的食管癌诊断生物标志物。因此,迫切需要开发更高效的无创生物标志物,用于食管鳞癌的早期检测。
miRNA是一类长度约为20-25个核苷酸的非编码RNA,能通过转录干扰或翻译抑制,调节基因表达。由于结构稳定,以及在血清中表达丰度高,miRNA有成为癌症无创生物标志物的潜力[5],是当今挖掘食管鳞癌血清标志物的研究热点。
近日,中国国家癌症中心的刘芝华教授联合美国、日本和南非的科学家,在国际顶级医学期刊Molecular Cancer上,发表了食管鳞癌miRNA血清标志物的重要研究成果[6]。
他们通过生信分析,挖掘和鉴定出食管鳞癌的八种血清高表达miRNA,并以此构建诊断模型,在几项大型、独立、多种族、多中心的回顾性和前瞻性队列中,证明该miRNA组合对食管鳞癌具有明显优于传统血清标志物的卓越诊断性能,而且经济便捷,具有强大的临床应用价值。
这个设计精巧的研究分为五个步骤,分别是:miRNA的数据挖掘鉴定、组织表达验证、血清表达验证,以及诊断模型的回顾性队列验证和前瞻性队列评估。研究样本来自中国、日本和南非的医院,一共约1800份来自食管鳞癌组织和癌旁正常组织,以及食管鳞癌患者和健康对照血清的临床样本。
研究伊始,刘芝华教授团队首先选定TCGA和GEO数据库的三个独立的食管鳞癌miRNA表达谱数据集,进行生物信息学分析,挖掘出18个在食管鳞癌组织中高表达的miRNA。
随后,他们在线鉴定了这18个候选miRNA对食管鳞癌的诊断性能。结果显示,在原来的三个食管鳞癌数据集中,候选miRNA的AUC都超过0.98,表现出优异的诊断潜力。此外,miRNA调控网络在线分析显示,候选miRNA的靶基因在癌症相关的信号通路中明显富集。
接着,研究人员对这18个候选miRNA进行了线下的组织表达验证。结果证实,相比于在癌旁正常组织,这18个候选miRNA在食管鳞癌组织中的表达的确显着上调。
既然研究的目的是开发食管鳞癌的一种无创液体活检标志物,而非有创的组织活检标志物。那么,这些在食管鳞癌组织中高表达的候选miRNA,有多少也是在患者的血清中高表达,从而能够转化为液体活检标志物?
为了评估这18个候选miRNA的转化潜力,研究人员在食管鳞癌患者和健康对照人群中,对它们在血清中的表达水平进行了检测。结果显示,这18个miRNA中,有8个(miR-103、miR-106b、miR-151、miR-17、miR-181a、miR-21、miR-25和miR-93)在食管鳞癌患者的血清中表达明显增多。
集合这8个miRNA,研究人员运用机器学习方法,构建了一个食管鳞癌miRNA血清标志物诊断模型。在包含了280例食管鳞癌患者和128例健康对照的训练队列中,该诊断模型的AUC达到0.83,敏感性为78%,特异性为75%,能很好地把食管鳞癌患者和健康人区分开来。
在另外两个独立的食管鳞癌回顾性队列研究中,miRNA诊断模型的表现依旧强劲,AUC都超过了0.8,对食管鳞癌的诊断能力得到了验证。
此外,和经典的食管鳞癌血清标志物SCC-Ag(AUC=0.72)相比,miRNA诊断模型(AUC=0.89)优势明显,尤其在早期食管鳞癌的诊断上,更是表现出强大的早期诊断潜力。
然而,以上的研究都是基于线上和回顾性分析,不能完全代替真实的临床环境。为了评估食管鳞癌miRNA血清标志物在现实中的应用潜能,研究人员招募患者发起了两项随机的前瞻性队列。
结果显示,在前瞻性队列研究中,miRNA诊断模型在区分食管鳞癌患者和健康对照方面,表现卓越(AUC=0.92,敏感性89%,特异性84%),大大优于传统的食管鳞癌血清标志物。
另外,研究人员还使用该miRNA诊断模型,对食管鳞癌的癌前病变——食管鳞状上皮内瘤变,进行了检测。结果发现,miRNA诊断模型能够识别高级别的食管鳞状上皮内瘤变患者,可用于早期检测高风险的食管鳞癌癌前病变。
最后,研究人员分析了成本效益,发现,使用这套食管鳞癌miRNA血清标志物诊断模型对高危人群进行大规模筛查,成本低廉而收益显着。
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